儿童与成人实体瘤综合组学分析及相关生物学研究样本库建立

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT01109394

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病类型：肉瘤、内分泌肿瘤、神经母细胞瘤、视网膜母细胞瘤、肾癌。背景：-基于实验室的研究有助于增进对癌症生物学的理解，并推动儿童恶性肿瘤新疗法的开发。目的：-对入组受试者进行系统性分子、基因组、蛋白质组、代谢组（“组学”）及其他分析，其中组学是指使用一系列先进技术进行的机制研究，以全面捕捉生物系统的各个方面，从而深入了解结构、功能和相互作用，更好地理解这些复杂过程和疾病。入选标准：任何年龄的儿童或成人受试者，符合以下条件之一：* 诊断为任何肿瘤或恶性肿瘤、癌前疾病或疑似癌症易感性家族综合征，无论年龄* 无恶性肿瘤的个体，因手术、其他治疗（如单采术）或正常健康体检或作为标准诊疗一部分的常规抽血而接受相关操作* 患有肿瘤或恶性肿瘤（儿童或成人）或疑似家族性癌症综合征受试者的生物学亲属。

已加入经批准的伴随方案的患者 * 先前已采集并可用于研究分析的血和/或组织标本 * 在常规患者护理所需的采样或操作过程中，可在对受试者附加风险最小的情况下采集生物标本。设计： * 本研究将允许为组织库采集标本，并用于指定的样本研究，包括系统性分子、基因组和蛋白质组（组学）分析，以及生长因子和细胞谱分析。 * 检测活动可能包括： * 从肿瘤和正常样本切片中提取DNA、RNA和蛋白质；其余部分将储存。 * 从淋巴细胞或其他未受累正常组织中提取生殖系DNA和RNA * 将从受试者亲属的淋巴细胞或其他未受累正常组织中提取生殖系DNA。 * 建立异种移植、外植体和细胞系

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。