结肠癌生物膜组成揭示独特细菌物种特征

数据集获取

源站：https://doi.org/10.17632/bnfwf63vcr

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 24.8 KB。

数据说明

摘要 人类结肠以生物膜的形式承载着一个高度组织化的保护性微生物生态系统，人们日益认识到，生物膜通过微生物失调及复杂的宿主-微生物群相互作用，是结直肠癌（CRC）进展的关键促进因素。在印度，CRC位居十大癌症之列，男性年龄标化发病率约为每10万人6.3例，女性约为每10万人3.7例，凸显出男性风险更高、诊断偏晚、筛查不足及治疗受限等问题，城市人群尤为明显。本研究旨在探究来自新德里印度CRC患者队列的结肠生物膜微生物组成，该地区CRC发病率正呈上升趋势。结肠活检样本取自印度新德里AIIMS胃肠科的（n = 15）肿瘤组织和（n = 15）邻近非肿瘤组织。采用荧光原位杂交（FISH）技术测定生物膜中的细菌种群。工作流程包括切片、脱蜡、组织透化、与细菌16S rDNA探针杂交，并通过共聚焦显微镜对检测信号进行可视化观察。

结果显示，微生物模式存在显著差异，肿瘤相关生物膜中大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌和脆弱拟杆菌的密度增加，而具核梭杆菌和产聚酮合酶大肠埃希菌（pks+）则较少见。这些结果证实了结直肠癌组织中存在显著的菌群失调和侵袭性生物膜的形成。了解这些生物膜的组成可能有助于制定针对性策略，以恢复微生物平衡并降低印度人群及全球人群的结直肠癌风险。要点 • 肿瘤相关生物膜在印度结直肠癌患者中表现出明显的微生物菌群失调。 • 观察到肿瘤部位大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌和脆弱拟杆菌富集。 • 对生物

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。