COLO-COHORT:结直肠健康与早期结直肠癌检测的肠道微生物组关联数据集

COLO-COHORT 是一个来源于 omicsdi.org 的肿瘤类数据集,主题标签为 Genomics,聚焦肠道微生物组与结直肠健康及早期结直肠癌检测之间的关联

omicsdi
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基因组分类Genomics
COLO-COHORT

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-24

资源简介

COLO-COHORT:结直肠健康与早期结直肠癌检测的肠道微生物组关联数据集

COLO-COHORT 是一个以 Genomics 为主题标签的肿瘤类数据集,来源于 omicsdi.org。该数据集围绕肠道微生物组与结直肠健康及早期结直肠癌检测之间的关联展开,英文名称为 COLO-COHORT。从整体定位看,它属于肿瘤研究领域中关注结直肠健康与微生物组关系的资源,适合用于探索肠道微生物组特征与结直肠健康状况之间可能存在的联系,并为早期结直肠癌检测相关研究提供数据支撑。其主题标签体现了基因组学在其中的核心地位,而来源站点的描述则进一步明确了数据集聚焦的方向,即肠道微生物组与结直肠健康及早期结直肠癌检测的关联研究。

【数据集背景】

COLO-COHORT 来源于 omicsdi.org,在分类上归属于肿瘤 / 其他类别。源站对其的描述为“COLO-COHORT: Exploring Gut Microbiome Associations of Colorectal Health and Early Colorectal Cancer Detection”,表明该数据集的核心关注点是探索肠道微生物组与结直肠健康以及早期结直肠癌检测之间的关联。主题标签为 Genomics,说明基因组学是该数据集的主要学科视角。结直肠健康与早期结直肠癌检测是肿瘤研究中的重要方向,而肠道微生物组作为与肠道环境密切相关的因素,其与结直肠健康之间的关联研究具有明确的科学意义。COLO-COHORT 正是在这一背景下形成的数据资源,服务于相关关联探索。

【数据内容】

COLO-COHORT 的主题标签为 Genomics,源站描述指向肠道微生物组与结直肠健康及早期结直肠癌检测的关联。关于数据集具体包含哪些样本、采用何种测序或检测技术、涵盖多少受试者、包含哪些具体字段与变量,源站未提供。因此,本数据集的具体数据内容构成无法进一步展开说明。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org,这是其来源站点信息。关于数据采集的具体地点、时间范围、采集流程、样本处理方式以及纳入标准等细节,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题标签与源站描述,COLO-COHORT 适用于与基因组学相关的结直肠健康研究,尤其是围绕肠道微生物组与结直肠健康关联的探索性分析,以及早期结直肠癌检测方向的研究。其肿瘤类数据集的定位也使其可服务于肿瘤研究领域中对结直肠相关问题的关注。关于更具体的适用场景、分析任务类型或应用案例,源站未提供。

【使用方法】

关于 COLO-COHORT 的访问方式、下载途径、数据格式、使用流程及分析建议,源站未提供。

【质量与限制】

关于该数据集的质量评估、数据完整性、样本代表性、潜在偏倚及使用限制等信息,源站未提供。

【引用与许可】

关于 COLO-COHORT 的引用方式、许可协议及使用条款等信息,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/project/PRJEB91658

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

COLO-COHORT: Exploring Gut Microbiome Associations of Colorectal Health and Early Colorectal Cancer Detection

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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