接受诱导化疗的肛癌患者循环生物标志物

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT05233540

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：肛门癌、局部晚期鳞状细胞癌、寡转移性疾病、循环肿瘤细胞、人乳头瘤病毒。肛门癌是一种罕见恶性肿瘤，丹麦每年约有200例新发病例，标准治疗为放化疗（CRT）。治疗集中在奥胡斯大学医院、Herlev医院和Vejle医院的三个肿瘤科。大多数肛门癌为鳞状细胞癌（SCCA），与人乳头瘤病毒（HPV）密切相关，在80%以上的病例中可在肿瘤组织中检测到HPV。对于肿瘤较大、肿瘤侵犯邻近器官和/或局部淋巴结转移的患者，在需要在确定性治疗前缩小肿瘤的情况下，可接受诱导化疗（ICT）。部分转移性（M1）SCCA患者也可接受ICT，目的是使确定性治疗成为可能。HPV、游离DNA、循环肿瘤DNA和免疫相关标志物：HPV是一个由130多种亚型组成的病毒群，其中一小部分被归类为致癌型。

在SCCA中最常见的HPV亚型是HPV-16和-18，但SCCA中HPV亚型分布的总体情况研究较少。循环中可以检测到细胞游离DNA（cfDNA）的小片段，癌症患者中其水平升高，但在其他情况下也会升高。DNA异常甲基化几乎发生在所有恶性肿瘤中，并释放入循环。肿瘤特异性甲基化DNA（meth-ctDNA）的水平可通过现代PCR技术进行分析。它似乎蕴含具有临床实用前景的生物学信息。文献主要集中在结直肠癌，meth-ctDNA已被引入作为预后标志物。其在肛门癌中的可能重要性尚未阐明，这是本方案的目标之一。通过简单的血液检测（即所谓的“液体活检”），可以同时表征总cfDNA和meth-ctDNA的水平。HPV相关肛门癌具有整合到基因组中的病毒序列

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。