HPV-SAVE_Merck 预防 HSIL 复发子研究

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT03947775

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件：肛门上皮内瘤变、肛门癌、人乳头瘤病毒。随着联合抗逆转录病毒治疗（cART）时代的到来，HIV感染者的治疗取得了显著进展，导致死亡率和发病率大幅下降。HIV阳性人群生存率的显著提高，使得人们开始关注这些个体的长期并发症，包括恶性肿瘤。事实上，在cART时代，已注意到HIV感染者中多种恶性肿瘤的发生率有所增加。其中包括与HPV相关的癌症，这类病毒是绝大多数宫颈癌（本身是一种公认的艾滋病（AIDS）定义性疾病）的病因，并与40%-90%的肛门癌、外阴癌、阴道癌、阴茎癌及口咽癌相关。更具体地说，最近的一项荟萃分析表明，肛门癌中HPV的总体患病率约为84%，其中HPV 16型在所有病例中分离出73%，使其成为肛门癌中最普遍的类型。尽管鳞状细胞肛门癌的发病率仅为每10万人中1例，但在普通人群中呈上升趋势。

在HIV阳性男性中，尤其是男男性行为者（MSM）中，其发生率显著更高，估计为每10万人60至160例。最近一项由北美艾滋病队列研究与设计协作组（NA-ACCORD）开展的研究，涵盖超过34,000名HIV感染者，发现HIV感染的MSM中肛门癌发生率最高，为每10万人年131例。事实上，在常规宫颈发育不良筛查采用之前，HIV感染的MSM中肛门癌的发生率与女性宫颈癌的发生率相当。除了与HPV的病因学关联外，肛门癌与宫颈癌还有许多相似之处。两者均为发生于鳞柱交界处的鳞状细胞癌，且均可能起源于组织学相似的癌前病变。据推测，肛门癌癌变过程中的一个关键步骤是持续性……

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。