不同壶腹癌亚型细胞系特征及癌相关成纤维细胞介导的反应

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD002657

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

引言：壶腹癌是一种相对罕见的疾病，通常采用胰十二指肠切除术并辅以辅助治疗。肠型亚型在切除后预后明显改善。可用于壶腹癌体外研究的细胞系很少，且尚未对其进行系统性特征描述。方法：我们通过亚型标志物表达、上皮-间质转化（EMT）特征、生长与侵袭、药物敏感性以及对癌症相关成纤维细胞条件培养基（CAF-CM）的反应，对可用的壶腹癌细胞系进行了特征描述。结果：基于EMT特征、亚型标志物表达、生长、侵袭和药物敏感性，可区分出三种类型的细胞系：间质样、胰胆管样和肠样。对CAF-CM的反应中，观察到生长增强、EMT诱导以及肠分化标志物受抑制，但呈现异质性模式。此外，对CAF反应的蛋白质组学分析将肠样细胞系与其他细胞系区分开来。

讨论：现有大多数AMPAC细胞系似乎呈现出低分化的胰胆管或间充质样表型，这与其来源相符。我们认为，对于肠型AMPAC而言，最佳的细胞系模型是SNU869细胞系，而其他细胞系则似乎反映了侵袭性较强的AMPAC亚型。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。