cBioPortal：葡萄膜黑色素瘤（QIMR，Oncotarget 2016）

资源简介

cBioPortal：葡萄膜黑色素瘤（QIMR，Oncotarget 2016）

该数据集在 cBioPortal 上名为 cBioPortal: Uveal Melanoma (QIMR, Oncotarget 2016)，源站标题为 Uveal Melanoma (QIMR, Oncotarget 2016)，来源站为 cbioportal.org，本站分类为肿瘤 / 其他，主题标签为 um。其核心内容是来自28个葡萄膜黑色素瘤样本的肿瘤/正常配对全基因组或全外显子测序，关联标识为 pmid:26683228。概括而言，这是一套聚焦葡萄膜黑色素瘤的配对肿瘤基因组测序数据资源，托管于 cBioPortal。

【数据集背景】

葡萄膜黑色素瘤是一种发生于眼内葡萄膜组织的黑色素瘤类型，属于肿瘤研究关注的病种之一。该数据集的源站标题中包含 Uveal Melanoma、QIMR 与 Oncotarget 2016 等字样，提示其与葡萄膜黑色素瘤以及相应研究来源有关。关联标识为 pmid:26683228。本站将其归入肿瘤 / 其他分类，并赋予主题标签 um，便于在肿瘤数据资源中识别和归类。来源站为 cbioportal.org，因此该数据属于 cBioPortal 所收录的肿瘤基因组数据集合之一。关于该数据集的完整研究背景、研究机构信息、发表期刊信息、研究问题、队列来源、伦理审批和项目资助情况，源站未提供。

【数据内容】

根据源站描述，该数据包含对28个葡萄膜黑色素瘤样本的肿瘤/正常配对进行全基因组或全外显子测序。也就是说，样本以肿瘤与正常组织配对的形式处理，测序策略为全基因组测序或全外显子测序。关于每个样本具体采用哪一种测序策略、样本的临床特征、突变谱、拷贝数变异、表达数据、甲基化数据、生存信息、治疗信息、数据文件类型和数据层级，源站未提供。数据是否包含原始测序读段、比对文件、变异调用结果，或仅包含汇总结果，源站未提供。主题标签 um 可用于标识该数据。样本量在上述描述中为28个葡萄膜黑色素瘤样本。

【采集与来源】

该数据的来源站为 cbioportal.org，源站标题为 Uveal Melanoma (QIMR, Oncotarget 2016)，在来源站上的名称写作 cBioPortal: Uveal Melanoma (QIMR, Oncotarget 2016)。关联标识为 pmid:26683228。标题中出现 QIMR 与 Oncotarget 2016 字样。关于样本采集地点、采集时间范围、伦理审批、知情同意、测序平台、测序中心、样本纳入与排除标准、配对正常样本来源、样本处理流程和测序质控流程，源站未提供。采集与来源的更多细节无法从现有信息中确定。

【适用场景】

该数据属于肿瘤基因组数据，本站分类为肿瘤 / 其他，主题标签为 um。通常可用于关注葡萄膜黑色素瘤及其配对肿瘤/正常样本的研究场景，例如在 cBioPortal 中浏览、检索或分析该队列的基因组信息。但具体适用的分析类型、研究问题、统计方法、临床解释和验证用途，源站未提供。是否适合比较全基因组与全外显子测序结果，是否适合特定变异分析，是否适合生存分析或药物靶点探索，源站也未说明。使用者应结合来源站功能和对应文献自行判断，但具体判断标准源站未提供。

【使用方法】

该数据托管于来源站 cbioportal.org。关于具体访问入口、检索关键词、数据集页面、下载方式、文件格式、API 调用、可视化工具、账号权限、数据版本和更新记录，源站未提供。主题标签 um 和标题 Uveal Melanoma (QIMR, Oncotarget 2016) 可作为识别线索，但具体操作步骤源站未提供。若需使用，应前往来源站查看可用说明，但来源站是否提供说明、说明内容如何，现有信息未覆盖。

【质量与限制】

源站描述仅说明对28个葡萄膜黑色素瘤样本的肿瘤/正常配对进行全基因组或全外显子测序。关于测序深度、覆盖度、质控指标、污染检测、批次效应、样本重复、缺失数据、数据完整性、注释版本、变异验证、临床注释准确性、样本代表性、统计功效和偏倚控制等，源站未提供。该数据涉及全基因组或全外显子两种策略，二者在覆盖范围和检测目标上通常不同；但本数据集中两种策略的具体分布及其对结果的影响，源站未提供。因此无法依据现有信息评价其质量高低或适用边界。

【引用与许可】

关联标识为 pmid:26683228，源站标题为 Uveal Melanoma (QIMR, Oncotarget 2016)。引用该数据时，应参考来源站 cbioportal.org 和对应文献的引用要求；但具体引用格式、作者列表、期刊信息、许可类型、使用条款、再分发限制、商业使用规定和署名要求，源站未提供。若需正式引用或二次使用，需自行核实来源站与相关发表物的许可与引用政策。除上述标识和来源信息外，引用与许可细节源站未提供。