cBioPortal:子宫癌肉瘤(TCGA,PanCancer Atlas)

数据来源于 cbioportal.org,源站提供原始数据与相关出版物的链接,并列出多个 PubMed 标识(pmid)

cbioportal
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基因组分类ucs
cBioPortal: Uterine Carcinosarcoma (TCGA, PanCancer Atlas)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

cBioPortal:子宫癌肉瘤(TCGA,PanCancer Atlas)

cBioPortal 收录的 Uterine Carcinosarcoma(TCGA, PanCancer Atlas)是一个面向子宫癌肉瘤的肿瘤基因组数据集,英文全称为 cBioPortal: Uterine Carcinosarcoma (TCGA, PanCancer Atlas),源站标题为 Uterine Carcinosarcoma (TCGA, PanCancer Atlas)。该数据集来自 cbioportal.org,在本站归入“肿瘤 / 其他”分类,主题标签为 ucs。源站说明其为 Uterine Carcinosarcoma TCGA PanCancer 数据,并提供原始数据链接与相关出版物链接,同时列出多个 PubMed 标识(pmid)。整体而言,该数据集属于 TCGA PanCancer Atlas 框架下针对子宫癌肉瘤的公开数据资源,适合用于查询、浏览和获取该癌种的基因组相关数据,并可通过源站提供的链接进一步追溯原始数据与发表文献。

【数据集背景】

该数据集对应的是子宫癌肉瘤(Uterine Carcinosarcoma)这一肿瘤类型,属于 TCGA PanCancer Atlas 项目的一部分。源站标题直接标明“Uterine Carcinosarcoma (TCGA, PanCancer Atlas)”,说明其数据背景与 TCGA PanCancer 计划相关。主题标签为 ucs,通常用于标识该癌种在数据库中的分类。源站描述指出,原始数据有对应链接,相关出版物也有对应链接,表明该数据集并非孤立存在,而是与更完整的原始数据存档和正式发表的文献相互关联。关于该癌种的流行病学、病理机制或临床背景,源站未提供,因此不在此展开。

【数据内容】

依据源站描述,该数据集为 Uterine Carcinosarcoma TCGA PanCancer 数据。源站提供原始数据链接与出版物链接,并列出多个 PubMed 标识(pmid),包括 pmid:29625048、29596782、29622463、29617662、29625055、29625050、29617662、32214244、296 等。这些标识指向与该数据集相关的已发表文献。关于数据集内具体包含哪些分子层面或临床层面的字段、样本数量、测序平台、突变或拷贝数等具体指标,源站未提供,因此无法进一步说明。

【采集与来源】

该数据集来源于 cbioportal.org。源站描述明确说明“The original data is here”,即原始数据可通过源站给出的链接获取;“The publications are here”则表明相关出版物也可通过链接访问。由此可见,该数据集在 cBioPortal 上以整合展示的形式存在,同时保留了对原始数据与文献的指向。关于样本采集地点、时间范围、伦理审批或具体实验流程,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于对子宫癌肉瘤(ucs)进行基因组数据查询与浏览的场景,也可用于追溯 TCGA PanCancer Atlas 中该癌种相关的原始数据与发表文献。由于源站提供了出版物链接和多个 PubMed 标识,研究人员可据此查找与该数据集相关的正式文献,进而了解其分析背景。关于该数据集是否适用于特定类型的统计分析、临床决策或诊断用途,源站未提供,因此不作推断。

【使用方法】

使用者可通过 cbioportal.org 访问该数据集,源站标题为 Uterine Carcinosarcoma (TCGA, PanCancer Atlas)。源站描述中给出了原始数据链接与出版物链接,用户可据此获取原始数据和相关文献。关于具体的检索方式、下载格式、API 接口或可视化操作步骤,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来自 cbioportal.org,并关联多个 PubMed 标识,说明其与已发表研究存在对应关系。但关于数据质量评估、样本纳入排除标准、数据完整性、更新频率或已知偏差,源站未提供。因此,使用时应以源站提供的原始数据和出版物为准,并注意源站未给出的具体质量指标无法在此确认。

【引用与许可】

该数据集列出了多个 PubMed 标识(pmid:29625048、29596782、29622463、29617662、29625055、29625050、29617662、32214244、296),可作为引用相关出版物的依据。源站描述中提供了出版物链接,便于用户查找正式文献。关于该数据集的具体许可条款、使用限制或再分发要求,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://cbioportal.org/study/summary?id=ucs_tcga_pan_can_atlas_2018

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Uterine Carcinosarcoma TCGA PanCancer data. The original data is here . The publications are here .

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