cBioPortal：复发性和转移性头颈癌（MSK，JAMA Oncol 2016）

资源简介

cBioPortal：复发性和转移性头颈癌（MSK，JAMA Oncol 2016）

cBioPortal 收录的 Recurrent and Metastatic Head & Neck Cancer (MSK, JAMA Oncol 2016) 是一个聚焦于晚期头颈肿瘤的靶向测序数据集。该数据集来源于纪念斯隆-凯特琳癌症中心（MSK）的研究工作，针对 151 例晚期、治疗抵抗性头颈肿瘤患者开展了靶向测序，相关研究成果发表于 JAMA Oncol 2016，对应文献标识为 pmid:27442865。数据集在 cBioPortal 平台上以“Recurrent and Metastatic Head & Neck Cancer (MSK, JAMA Oncol 2016)”为标题发布，本站将其归类于肿瘤 / 其他类别，主题标签为 head_neck。该数据集为研究复发性和转移性头颈肿瘤的基因组特征提供了可访问的测序数据资源。

【数据集背景】

头颈肿瘤是一类发生于头颈部区域的恶性肿瘤，晚期、复发及转移性病例的治疗选择有限，预后往往较差。针对这类治疗抵抗性肿瘤开展分子层面的研究，有助于理解其潜在的基因组改变。该数据集正是围绕这一临床问题而建立，来源于纪念斯隆-凯特琳癌症中心（MSK）的研究项目，其成果发表于 JAMA Oncol 2016，文献标识为 pmid:27442865。数据集通过 cBioPortal 平台对外发布，属于肿瘤 / 其他分类，主题标签为 head_neck，便于研究者按癌种和主题进行检索与整合分析。

【数据内容】

该数据集收录了 151 例晚期、治疗抵抗性头颈肿瘤患者的靶向测序数据。数据以靶向测序为核心内容，聚焦于复发和转移性头颈肿瘤样本。数据集在 cBioPortal 上的标题为“Recurrent and Metastatic Head & Neck Cancer (MSK, JAMA Oncol 2016)”，英文名称为 cBioPortal: Recurrent and Metastatic Head & Neck Cancer (MSK, JAMA Oncol 2016)。除上述信息外，关于具体测序 panel 覆盖的基因列表、变异类型、临床注释字段、样本数量与患者数量的对应关系等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 cbioportal.org，由纪念斯隆-凯特琳癌症中心（MSK）的研究者完成，相关研究发表于 JAMA Oncol 2016，文献标识为 pmid:27442865。数据采集的对象为 151 例晚期、治疗抵抗性头颈肿瘤患者，采集方式为靶向测序。数据集在 cBioPortal 平台上以“Recurrent and Metastatic Head & Neck Cancer (MSK, JAMA Oncol 2016)”为标题发布。关于具体的样本采集流程、测序平台、建库方法、伦理审批信息以及数据提交与更新记录等，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于头颈肿瘤相关的基因组学研究，尤其是针对复发性和转移性、治疗抵抗性病例的探索性分析。研究者可利用该数据集考察晚期头颈肿瘤中的靶向测序结果，用于癌种分子特征的描述、候选基因或通路的初步筛选，以及与其他头颈肿瘤数据集的比较研究。由于数据集聚焦于晚期、治疗抵抗性人群，也可用于关注治疗耐药机制的研究场景。此外，该数据集可作为 cBioPortal 平台上头颈肿瘤主题数据的一部分，支持跨数据集的整合查询与可视化探索。关于该数据集是否适用于特定类型的临床决策或诊断用途，源站未提供。

【使用方法】

该数据集通过 cBioPortal 平台（cbioportal.org）提供访问。使用者可在 cBioPortal 上按数据集标题“Recurrent and Metastatic Head & Neck Cancer (MSK, JAMA Oncol 2016)”进行检索，或通过主题标签 head_neck 以及肿瘤 / 其他分类进行浏览。cBioPortal 通常提供在线查询、可视化与数据下载等功能，用户可据此查看该数据集的测序结果并进行探索性分析。关于该数据集的具体下载格式、文件结构、API 访问方式以及是否需要注册或遵守特定访问条件，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集基于 151 例晚期、治疗抵抗性头颈肿瘤患者的靶向测序，样本聚焦于复发和转移性病例，因此其覆盖范围并不代表全部头颈肿瘤人群。靶向测序通常仅覆盖特定基因区域，可能无法全面反映全基因组或全外显子层面的改变。该数据集的相关成果发表于 JAMA Oncol 2016，其数据内容与当时的研究设计相对应。关于数据质量评估指标、缺失值情况、样本排除标准、测序深度与覆盖度等具体质量信息，源站未提供。

【引用与许可】

使用该数据集时，应引用其关联文献，文献标识为 pmid:27442865，对应发表于 JAMA Oncol 2016 的研究成果。数据集在 cBioPortal 上的标题为“Recurrent and Metastatic Head & Neck Cancer (MSK, JAMA Oncol 2016)”，来源站为 cbioportal.org。关于该数据集的具体许可协议、使用条款、再分发限制以及商业使用规定等，源站未提供。