cBioPortal：前列腺腺癌（MSK，PNAS 2014）

资源简介

cBioPortal：前列腺腺癌（MSK，PNAS 2014）

cBioPortal: Prostate Adenocarcinoma (MSK, PNAS 2014) 是收录于 cbioportal.org 的一个前列腺腺癌数据集，其核心内容是对 104 对原发前列腺癌肿瘤/正常配对样本进行全基因组拷贝数分析，原始数据可通过 GEO（编号 GSE54691）获取，关联的文献标识为 pmid:25024180。

【数据集背景】

该数据集在源站的标题为 Prostate Adenocarcinoma (MSK, PNAS 2014)，在分类上归入“肿瘤 / 其他”，主题标签为 prad，简短的侧写描述同样是 Prostate Adenocarcinoma (MSK, PNAS 2014)。从名称可以看出，这是一个以前列腺腺癌为对象、标注年份为 2014 年的研究型数据集。关于研究开展的具体机构、发表期刊的完整信息、研究设计与科学问题的详细背景，源站未提供，因此此处不做展开。数据集关联的文献标识为 pmid:25024180，可用于追溯其学术出处。

【数据内容】

源站描述明确指出，该数据集提供的是 104 对原发前列腺癌肿瘤/正常配对样本的全基因组拷贝数分析结果（Genome-wide copy number profiling in 104 primary prostate cancer tumor/normal pairs）。也就是说，其数据主体是成对的肿瘤与正常样本之间的拷贝数层面信息，而非点突变、基因表达或其他组学层面。关于具体的拷贝数区间、所覆盖的基因或基因组区域、变异检出阈值、样本所附带的临床注释字段、随访或生存信息等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 cbioportal.org，原始数据经由 GEO 提供，登录号为 GSE54691。样本类型为原发前列腺癌肿瘤及其配对的正常组织，共 104 对。关于样本的采集时间、采集地点、处理流程、检测平台、数据预处理与归一化方式等信息，源站未提供。

【适用场景】

从数据内容来看，该数据集适合用于关注前列腺腺癌拷贝数变化的研究场景，例如作为拷贝数层面探索性分析的输入、与其他前列腺癌队列做比较研究、或用于方法学验证与二次分析等。由于样本为肿瘤/正常配对设计，也便于开展以配对结构为基础的分析思路。需要说明的是，源站未提供针对具体应用方向的推荐或限制说明，使用时应以源站描述所界定的范围为准。

【使用方法】

该数据集托管于 cbioportal.org，可通过该站点进行访问与浏览。原始数据可通过 GEO 以编号 GSE54691 检索获取。关于在站点内的具体检索路径、可视化模块、可下载的文件格式与版本管理方式等操作层面的说明，源站未提供。

【质量与限制】

已知的规模信息为 104 对原发前列腺癌肿瘤/正常配对样本，数据层面为全基因组拷贝数分析。该数据集不涵盖拷贝数以外的组学信息，因而无法支持对突变谱、表达谱或蛋白层面的直接研究。关于数据质量指标、缺失情况、批次效应、样本纳入排除标准以及使用上的其他限制，源站未提供。

【引用与许可】

使用该数据集时，建议标注其标题 Prostate Adenocarcinoma (MSK, PNAS 2014)，并引用关联文献标识 pmid:25024180；原始数据应指向 GEO 登录号 GSE54691。关于具体的许可条款、使用协议与再分发规定，源站未提供。