SU2C-PCF 转移性去势抵抗性前列腺癌多组学数据集
由 Stand Up To Cancer (SU2C) 和前列腺癌基金会 (PCF) 联合整理的经典数据集,包含150例临床转移性去势抵抗性前列腺癌(IV期)患者的多组学测序与临床随访数据。由Stand Up To Cancer / cBioPortal提供,来自cBioPortal for Cancer Genomics,数据格式为表格,适用于分类任务,专注于肿瘤领域的转移性(IV期)前列腺癌研究。

基本信息
资源简介
SU2C-PCF 转移性去势抵抗性前列腺癌多组学数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Metastatic Prostate Adenocarcinoma (SU2C/PCF Dream Team, PNAS 2019)》。
【数据内容】
源站原始描述:Whole exome sequencing of 444 castrate resistant prostate cancer tumor/normal pairs. SU2C-PCF Dream Team: Precision Therapy for Advanced Prostate Cancer
【数据结构与技术规格】
数据集 DOI:pmid:31061129。
【主题与分类】
主题标签:prad。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面:https://www.cbioportal.org/study/summary?id=prad_su2c_2019
规范引用:Abida et al. PNAS 2019
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
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使用方式
数据集获取
源站:https://www.cbioportal.org/study/summary?id=prad_su2c_2019
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 0.80 GB。
数据说明
由 Stand Up To Cancer (SU2C) 和前列腺癌基金会 (PCF) 联合整理的经典数据集,包含150例临床转移性去势抵抗性前列腺癌(IV期)患者的多组学测序与临床随访数据。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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