cBioPortal:前列腺腺癌(MSK/DFCI,Nature Genetics 2018)
该资源与 Nature Genetics 2018 年发表的研究相关,名称中标注了 MSK/DFCI 两个研究机构来源。主题围绕前列腺腺癌,来源站为 cbioportal.org,在当前平台归类于“肿瘤 / 其他”

基本信息
资源简介
cBioPortal:前列腺腺癌(MSK/DFCI,Nature Genetics 2018)
该资源是来自 cbioportal.org 的前列腺腺癌数据集合,标题为 Prostate Adenocarcinoma (MSK/DFCI, Nature Genetics 2018),涉及对 1013 例前列腺癌样本及其配对正常样本进行全外显子组测序,相关文献可对应 PMID:29610475。
【数据集背景】
该资源与 Nature Genetics 2018 年发表的研究相关,名称中标注了 MSK/DFCI 两个研究机构来源。主题围绕前列腺腺癌,来源站为 cbioportal.org,在当前平台归类于“肿瘤 / 其他”。其标签为 prad,可作为前列腺腺癌相关检索标识。除上述信息外,源站未提供更详细的研究设计、队列背景、纳排标准或机构分工说明。
【数据内容】
来源站介绍指出,该资源包含 1013 例前列腺癌样本及其配对正常样本的全外显子组测序。配对正常样本通常可用于与肿瘤样本进行对照分析。主题标签为 prad。除样本数量、癌种、测序类型和配对正常样本外,源站未提供关于具体基因列表、变异类型、临床注释、生存信息、样本元数据、数据文件结构或衍生分析结果等细节。
【采集与来源】
该资源来自 cbioportal.org,源站标题为 Prostate Adenocarcinoma (MSK/DFCI, Nature Genetics 2018)。相关文献标识为 pmid:29610475,命名中体现 MSK/DFCI 以及 Nature Genetics 2018。关于样本采集地点、时间范围、伦理审批、知情同意、测序平台、建库方法、中心实验室流程等,源站未提供。
【适用场景】
从来源站介绍看,该资源围绕前列腺腺癌的全外显子组测序和配对正常样本,一般可用于前列腺腺癌相关的肿瘤基因组探索,例如在获得授权并符合规范的前提下,对肿瘤与配对正常样本进行变异比较等分析。由于分类为“肿瘤 / 其他”,也可作为肿瘤基因组资源检索和整合时的候选数据。具体研究问题是否适用,需结合源站提供的文档和许可条款判断;源站未提供明确的适用场景建议或限制说明。
【使用方法】
该资源的来源站为 cbioportal.org,可通过该来源站获取进一步信息。关于具体下载格式、访问权限、是否需要注册、是否提供接口、如何在本地或云端分析、推荐流程和参数设置等,源站未提供。
【质量与限制】
源站未提供关于测序深度、覆盖均一性、样本合格标准、质控指标、批次效应、污染评估、缺失数据比例或验证实验等质量信息。该资源主题为前列腺腺癌,跨癌种外推时需要谨慎,并应进行额外验证。由于缺乏详细的临床和方法学元数据说明,使用前需结合原始来源和对应发表文献自行评估。除上述内容外,源站未提供其他质量与限制说明。
【引用与许可】
引用时可使用源站标题 Prostate Adenocarcinoma (MSK/DFCI, Nature Genetics 2018),并关联 PMID:29610475。许可与使用条款、数据共享协议、商业使用限制、再分发条件等,源站未提供。使用前应查阅来源站 cbioportal.org 以及对应文献的正式说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://cbioportal.org/study/summary?id=prad_p1000
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
1013例前列腺癌样本及其配对正常样本的全外显子组测序。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




