cBioPortal：非小细胞肺癌（MSK，2026）
该数据集来自 cBioPortal，收录 90 例非小细胞肺癌病例及其配对正常样本，采用 MSK-IMPACT 进行靶向测序，研究对象为 MSK 的 ALK 融合肺肿瘤队列，目的是探究 ALK 酪氨酸激酶抑制剂（TKI）获得性耐药
基本信息
资源简介
cBioPortal：非小细胞肺癌（MSK，2026）
cBioPortal 收录的 Non-Small Cell Lung Cancer (MSK, 2026) 是一个聚焦于非小细胞肺癌靶向测序的肿瘤数据集。该数据集以 90 例非小细胞肺癌病例及其配对正常样本为对象，采用 MSK-IMPACT 进行靶向测序，研究背景为 MSK 的 ALK 融合肺肿瘤队列，核心研究目的是探究 ALK 酪氨酸激酶抑制剂（TKI）的获得性耐药机制。数据集在站内归入肿瘤 / 其他分类，主题标签为 nsclc，来源站为 cbioportal.org。对于关注 ALK 融合阳性非小细胞肺癌耐药问题的研究者而言，该数据集提供了来自特定临床队列的测序资源，可用于探索耐药相关的基因组改变。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。
【数据集背景】
非小细胞肺癌是肺癌中最常见的类型之一，其中 ALK 融合阳性肿瘤对 ALK 酪氨酸激酶抑制剂（TKI）初始治疗通常敏感，但获得性耐药往往导致疾病进展。该数据集正是围绕这一临床问题构建，研究对象为 MSK 的 ALK 融合肺肿瘤队列，通过靶向测序手段分析 90 例非小细胞肺癌病例及其配对正常样本，以探究 ALK TKI 获得性耐药的基因组基础。数据集的标题和来源信息表明其由 MSK 相关研究产生，并在 cBioPortal 平台上发布，时间标注为 2026 年。
【数据内容】
该数据集收录 90 例非小细胞肺癌病例及其匹配的正常样本。测序采用 MSK-IMPACT 靶向测序面板。源站描述明确指出，测序目的是研究 MSK ALK 融合肺肿瘤队列中对 ALK 酪氨酸激酶抑制剂（TKI）的获得性耐药。数据集的主题标签为 nsclc。除上述信息外，关于具体的基因列表、变异类型、临床注释字段、样本处理细节等内容，源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于 cbioportal.org，源站标题为 Non-Small Cell Lung Cancer (MSK, 2026)。样本来自 MSK 的 ALK 融合肺肿瘤队列，包含 90 例非小细胞肺癌病例及其配对正常样本，通过 MSK-IMPACT 进行靶向测序。关于样本采集时间、采集地点、伦理审批信息、测序平台版本、数据生成的具体流程等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于非小细胞肺癌中 ALK 融合阳性肿瘤对 ALK TKI 获得性耐药的研究场景。研究者可利用该队列的靶向测序数据，探索耐药相关的基因组变异，或将其作为特定临床队列的验证资源。由于数据集包含配对正常样本，也可用于区分肿瘤特异性改变与胚系背景。关于是否适用于其他癌种、其他 TKI 或其他研究目的，源站未提供。
【使用方法】
该数据集发布在 cBioPortal 平台，用户可通过 cbioportal.org 访问。关于具体的数据下载方式、文件格式、API 接口、可视化分析工具、登录或权限要求等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于 MSK-IMPACT 靶向测序，样本量为 90 例非小细胞肺癌病例及其配对正常样本，研究目的明确为 ALK TKI 获得性耐药。关于数据完整性、测序深度、覆盖度、变异检出灵敏度、批次效应、样本排除标准、数据更新频率等质量相关信息，源站未提供。使用时应结合源站的最新说明进行评估。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款、数据共享政策以及是否允许再分发等信息，源站未提供。使用前应查阅 cbioportal.org 上的相关说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://cbioportal.org/study/summary?id=alk_msk_2026
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
通过MSK-IMPACT对90例非小细胞肺癌病例及其匹配的正常组织进行靶向测序，以研究MSK ALK融合肺肿瘤队列中对ALK酪氨酸激酶抑制剂（TKIs）的获得性耐药。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
