cBioPortal:转移性乳腺癌(AURORA US Network,Nat Cancer 2023)
该数据集来自 cBioPortal,收录 AURORA US Network 于 Nat Cancer 2023 发布的转移性乳腺癌数据,包含 55 例患者的全外显子测序和低通量全基因组测序结果,涵盖 53 个原发癌与 102 个转移灶,并配有匹配的正常样本

基本信息
资源简介
cBioPortal:转移性乳腺癌(AURORA US Network,Nat Cancer 2023)
Metastatic Breast Cancer (AURORA US Network, Nat Cancer 2023)
该数据集来自 cBioPortal,收录 AURORA US Network 于 Nat Cancer 2023 发布的转移性乳腺癌数据,包含 55 例患者的全外显子测序和低通量全基因组测序结果,涵盖 53 个原发癌与 102 个转移灶,并配有匹配的正常样本。数据为回顾性组织采集,由 Breast Cancer Research Foundation 发起。可用于乳腺癌转移相关基因组特征分析、原发与转移灶比较及变异分类等研究(来源 cBioPortal)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):对55例转移性乳腺癌患者(53个原发癌和102个转移灶)及其匹配的正常样本进行全外显子测序和低通量全基因组测序。回顾性组织采集;由Breast Cancer Research Foundation发起的一项计划。
【数据结构与技术规格】
数据集 DOI:pmid:36585450。
【主题与分类】
主题标签:brca。本站分类:肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://www.cbioportal.org/study/summary?id=brca_aurora_2023
规范引用:Garcia-Recio et al. Nat Cancer 2023
下载信息
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源站:https://cbioportal.org/study/summary?id=brca_aurora_2023
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
对55例转移性乳腺癌患者(53例原发癌和102例转移灶)及其匹配的正常样本进行了全外显子组测序和低深度全基因组测序。回顾性组织采集;乳腺癌研究基金会的一项倡议。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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