cBioPortal：肺腺癌（TCGA，Nature 2014）

资源简介

cBioPortal：肺腺癌（TCGA，Nature 2014）

cBioPortal 收录的 Lung Adenocarcinoma (TCGA, Nature 2014) 数据集，对应 TCGA 肺腺癌（LUAD）项目的一项全外显子测序研究。该数据集以 230 对肿瘤与正常样本配对为核心，围绕肺腺癌这一肿瘤类型提供基因组层面的数据资源，主题标签为 luad。作为来自 cbioportal.org 的公开数据集，它面向肿瘤基因组学与精准医学相关研究，便于研究者围绕肺腺癌的体细胞变异、基因突变谱及肿瘤—正常配对差异开展探索性分析。该数据集在 cBioPortal 中被归入肿瘤 / 其他分类，其原始数据可通过 TCGA Data Portal 获取，相关研究发表于 Nature 2014，并对应 PMID:25079552。

【数据集背景】

肺腺癌是非小细胞肺癌中最常见的亚型之一，针对其开展大规模基因组测序有助于揭示驱动基因与分子特征。该数据集源自 TCGA 肺腺癌项目，属于 cBioPortal 平台收录的肿瘤基因组数据集之一。其源站标题为 Lung Adenocarcinoma (TCGA, Nature 2014)，说明该数据与 2014 年发表于 Nature 的 TCGA 肺腺癌研究成果相对应。数据集的主题标签为 luad，指向肺腺癌这一特定癌种。整体来看，该数据集是围绕肺腺癌肿瘤与正常样本配对开展全外显子测序所形成的数据资源，服务于肿瘤分子机制与临床转化研究。

【数据内容】

该数据集的核心内容是肺腺癌肿瘤与正常样本配对的全外显子测序数据，覆盖 230 对肿瘤/正常配对。全外显子测序通常用于捕获蛋白编码区域及其侧翼序列中的变异信息，因此该数据集可用于考察肺腺癌样本中的基因突变、体细胞变异等基因组改变。数据以肿瘤与正常样本配对的形式组织，意味着每个病例同时包含肿瘤样本和与之对应的正常样本，便于进行肿瘤特异性变异的识别与过滤。除上述内容外，关于具体基因列表、突变位点数量、样本临床注释字段等更细粒度的信息，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来自 cbioportal.org，源站描述指出其包含 230 对肺腺癌肿瘤/正常样本的全外显子测序，原始数据可通过 TCGA Data Portal 获取。其 DOI 标注为 pmid:25079552，对应相关研究成果的发表信息。数据集在 cBioPortal 中的分类为肿瘤 / 其他，主题标签为 luad。关于样本采集地点、测序平台、建库方法、数据处理流程等实验与生产细节，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肺腺癌基因组学相关的研究场景，例如探索肺腺癌中反复出现的基因突变、比较肿瘤与正常样本之间的基因组差异、开展候选驱动基因的筛选与验证，以及作为肿瘤精准医学或分子分型研究的公共数据资源。由于数据以肿瘤/正常配对形式提供，也适合用于需要配对设计来识别体细胞变异的分析。关于该数据集在特定临床终点、疗效预测或诊断模型中的适用性，源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过 cBioPortal 平台访问，源站为 cbioportal.org。原始数据可通过 TCGA Data Portal 获取。关于具体的下载方式、数据格式、接口调用方法、分析工具推荐或访问权限要求，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集覆盖 230 对肺腺癌肿瘤/正常样本的全外显子测序，样本规模与配对设计是其重要特征。关于数据质量评估指标、覆盖深度、变异检出灵敏度与特异性、批次效应、样本纳入排除标准以及潜在偏倚等信息，源站未提供。使用者在解释结果时应结合源站描述与原始数据获取渠道自行评估适用性。

【引用与许可】

该数据集对应 DOI 为 pmid:25079552，相关研究发表于 Nature 2014。使用该数据集时，应引用对应的研究成果与数据来源。关于许可条款、使用限制、商业用途规定及再分发要求，源站未提供。