cBioPortal：肺腺癌（CAS，Cell 2020）

资源简介

cBioPortal：肺腺癌（CAS，Cell 2020）

cBioPortal 收录的 Lung Adenocarcinoma (CAS, Cell 2020) 是一个聚焦中国肺腺癌人群的肿瘤基因组数据集。该数据集以肺腺癌（LUAD）为核心主题，整合了 103 例中国肺腺癌患者及其配对正常样本的全外显子测序结果，并以 cBioPortal 作为发布与浏览平台。对于关注东亚人群肺腺癌分子特征的研究者而言，这一数据集提供了以配对正常样本为参照的测序资源，可用于探索肿瘤与正常组织之间的基因组差异。其来源标注为 cbioportal.org，相关文献标识为 pmid:32649877，主题标签为 luad，在本站归入肿瘤 / 其他分类。

【数据集背景】

肺腺癌是非小细胞肺癌中最常见的亚型之一，其发生发展涉及复杂的基因组改变。该数据集对应的研究以中国肺腺癌患者为对象，采用全外显子测序策略，对 103 例肿瘤及其匹配的正常样本进行检测。与仅关注肿瘤组织的数据集不同，配对正常样本的引入为识别体细胞变异提供了必要的对照基础。该数据集发表于 Cell 期刊（2020 年），并通过 cBioPortal 平台对外提供访问，便于研究者在线浏览、检索和下载相关数据。数据集的标题中“CAS”与“Cell 2020”共同标识了其研究来源与发表信息。

【数据内容】

该数据集的核心内容是 103 例中国肺腺癌患者及其配对正常样本的全外显子测序数据。全外显子测序覆盖基因组中的蛋白编码区域，适合用于发现与肿瘤相关的编码区变异。由于每例患者均配有正常样本，数据可用于区分肿瘤中获得的体细胞改变与个体固有的胚系变异。数据集的主题标签为 luad，表明其与肺腺癌这一疾病类型直接相关。在本站分类中，该数据集归入肿瘤 / 其他类别。除上述信息外，关于具体基因突变谱、突变负荷、拷贝数变异或临床注释等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 cbioportal.org，源站标题为 Lung Adenocarcinoma (CAS, Cell 2020)。其原始研究针对中国肺腺癌患者队列，采集了 103 例患者的肿瘤样本及其匹配正常样本，并开展全外显子测序。相关文献的 PubMed 标识为 pmid:32649877，发表于 Cell（2020 年）。cBioPortal 作为肿瘤基因组数据的常用门户，承担了该数据集的展示与分发功能。关于样本采集的具体时间、地点、机构、入组标准及伦理审批等信息，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肺腺癌基因组学的探索性研究，尤其是针对中国患者人群的分析。典型用途包括：利用配对正常样本识别肿瘤体细胞变异；在全外显子层面考察编码区基因的改变；将本数据集与其他肺腺癌队列进行比较研究；以及作为 cBioPortal 平台上肺腺癌相关查询与可视化的数据来源之一。由于主题标签为 luad，该数据集也可用于肺腺癌分子分型或候选基因筛选等方向的初步分析。需要说明的是，具体分析类型与适用范围应以原始研究和数据本身的质量评估为准，源站未提供额外的适用性说明。

【使用方法】

该数据集可通过 cbioportal.org 访问，用户可在 cBioPortal 平台上浏览其标题 Lung Adenocarcinoma (CAS, Cell 2020) 对应的数据内容。使用时应遵循 cBioPortal 平台的一般操作方式，例如在线检索、查看和下载数据。关于该数据集的具体下载格式、文件结构、是否需要注册、是否有使用教程或 API 接口等信息，源站未提供。建议使用者结合原始文献（pmid:32649877）了解研究设计与数据生成过程，并按照平台指引进行数据获取与分析。

【质量与限制】

该数据集基于 103 例中国肺腺癌患者及其配对正常样本的全外显子测序，样本量与测序策略已在源站描述中明确。全外显子测序主要覆盖编码区域，对非编码区及结构变异的检测能力有限，这是该方法本身的通用特点。关于数据质量评估指标、测序深度、覆盖度、变异检出率、批次效应、样本排除标准及潜在偏倚等信息，源站未提供。此外，该数据集聚焦中国患者人群，其结论外推至其他人群时需谨慎。使用者应结合原始文献与自身研究目的评估数据适用性。

【引用与许可】

引用该数据集时，应参考其对应的原始文献，PubMed 标识为 pmid:32649877，发表于 Cell（2020 年）。数据集通过 cbioportal.org 发布，标题为 Lung Adenocarcinoma (CAS, Cell 2020)。关于该数据集的具体许可协议、使用条款、是否允许再分发或商业使用等信息，源站未提供。建议使用者在下载或使用前查阅 cBioPortal 平台及原始出版方的相关规定，并按要求进行引用与致谢。