cBioPortal:结肠腺癌(TCGA GDC,2025)

数据集主题标签为 coad,属于肿瘤领域。可用于结肠腺癌相关的基因组与临床数据探索,支持肿瘤分类、分子特征分析等研究用途(来源 cBioPortal)

cbioportal
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基因组分类coad
cBioPortal: Colon Adenocarcinoma (TCGA GDC, 2025)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-03

资源简介

cBioPortal:结肠腺癌(TCGA GDC,2025)

cBioPortal 上的 Colon Adenocarcinoma (TCGA GDC, 2025) 是一个聚焦结肠腺癌的肿瘤类数据集,英文名称为 cBioPortal: Colon Adenocarcinoma (TCGA GDC, 2025),源站标题为 Colon Adenocarcinoma (TCGA GDC, 2025)。该数据集来源于 cbioportal.org,主题标签为 coad,属于肿瘤领域。其源数据来自 NCI GDC,并于 2025 年 8 月通过 Cancer Data Aggregator 生成。该数据集可用于结肠腺癌相关的基因组与临床数据探索,支持肿瘤分类、分子特征分析等研究用途。整体而言,它为关注结肠腺癌分子机制与临床特征的研究人员提供了一个可访问的数据资源入口,便于在 cBioPortal 平台上开展探索性分析。

【数据集背景】

结肠腺癌是结直肠癌中最常见的病理类型之一,针对该类肿瘤的分子与临床研究长期依赖大规模、标准化的公共数据资源。该数据集以 TCGA 结肠腺癌项目为基础,由 cBioPortal 收录并呈现,源数据取自 NCI GDC,并于 2025 年 8 月使用 Cancer Data Aggregator 生成。其主题标签为 coad,在 cBioPortal 的分类体系中归入肿瘤 / 其他类别。该数据集的建立,延续了 TCGA 系列肿瘤数据在 cBioPortal 上的整合与展示方式,为结肠腺癌研究提供了一个较新的数据版本。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 coad,属于肿瘤领域,围绕结肠腺癌展开。依据源站描述,其内容为 TCGA Colon Adenocarcinoma 相关数据,源数据来自 NCI GDC。就可用方向而言,该数据集可用于结肠腺癌相关的基因组与临床数据探索,支持肿瘤分类、分子特征分析等研究用途。关于具体的样本数量、测序平台、基因列表、临床字段、突变谱或表达谱等详细内容,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 cbioportal.org,源数据来自 NCI GDC,并于 2025 年 8 月使用 Cancer Data Aggregator 生成。源站标题为 Colon Adenocarcinoma (TCGA GDC, 2025)。除上述来源与生成信息外,关于具体的采集流程、纳入排除标准、样本处理方式及更新周期等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于结肠腺癌相关的基因组与临床数据探索,可支持肿瘤分类、分子特征分析等研究用途。研究人员可借助该数据集开展与结肠腺癌分子特征相关的探索性工作,也可将其用于肿瘤分类相关的分析场景。关于更具体的适用场景、分析类型或研究设计,源站未提供。

【使用方法】

该数据集收录于 cbioportal.org,用户可通过该来源站访问。关于具体的检索方式、下载途径、接口调用方法、数据格式及分析工具使用说明等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集的源数据来自 NCI GDC,并于 2025 年 8 月使用 Cancer Data Aggregator 生成,来源站为 cbioportal.org。关于数据质量评估、完整性、准确性、覆盖范围、已知偏差或使用限制等,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集英文名称为 cBioPortal: Colon Adenocarcinoma (TCGA GDC, 2025),源站标题为 Colon Adenocarcinoma (TCGA GDC, 2025),来源站为 cbioportal.org。关于具体的引用格式、许可条款、使用条件及再分发要求等,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://cbioportal.org/study/summary?id=coad_tcga_gdc

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

TCGA Colon Adenocarcinoma. Source data from NCI GDC and generated in Aug 2025 using Cancer Data Aggregator .

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