cBioPortal:结肠腺癌(CaseCCC,PNAS 2015)

其核心信息是来自 29 例非裔美国人结肠癌的肿瘤/正常配对全外显子测序。该数据集带有 coad 标签,关联文献标识为 pmid:25583493,标题中同时出现 CaseCCC 与 PNAS 2015

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cBioPortal: Colon Adenocarcinoma (CaseCCC, PNAS 2015)

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-11-06

资源简介

cBioPortal:结肠腺癌(CaseCCC,PNAS 2015)

cBioPortal 上的 Colon Adenocarcinoma (CaseCCC, PNAS 2015) 数据集,来源站为 cbioportal.org,归入肿瘤 / 其他类别,简短描述与源站标题一致。其核心信息是来自 29 例非裔美国人结肠癌的肿瘤/正常配对全外显子测序。该数据集带有 coad 标签,关联文献标识为 pmid:25583493,标题中同时出现 CaseCCC 与 PNAS 2015。

【数据集背景】

该数据集的英文名称为 cBioPortal: Colon Adenocarcinoma (CaseCCC, PNAS 2015),源站标题为 Colon Adenocarcinoma (CaseCCC, PNAS 2015)。它发布在 cbioportal.org,属于肿瘤 / 其他类别,并带有 coad 标签。来源站对它的说明是:来自 29 例非裔美国人结肠癌的肿瘤/正常配对全外显子测序。标题中的 CaseCCC 具体指代、PNAS 2015 所对应的研究团队、研究机构、研究设计细节以及完整背景,源站未提供。

【数据内容】

来源站描述明确指出,该数据集包含全外显子测序数据,覆盖肿瘤/正常配对样本,样本来自 29 例非裔美国人结肠癌。标题使用 Colon Adenocarcinoma,即结肠腺癌;来源站描述使用 Colon Cancers,即结肠癌。数据集带有 coad 标签,并归入肿瘤 / 其他类别。关于具体基因、突变列表、拷贝数变异、结构变异、表达数据、临床变量、随访信息、样本人口学细节、数据文件格式、数据版本、原始测序数据与处理后数据的区分,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源站为 cbioportal.org,源站标题为 Colon Adenocarcinoma (CaseCCC, PNAS 2015)。来源站描述强调,该数据来自 29 例非裔美国人结肠癌的肿瘤/正常配对全外显子测序。关联文献标识为 pmid:25583493,标题中包含 PNAS 2015。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批、知情同意、测序平台、建库方法、样本纳入与排除标准、肿瘤纯度评估方式、正常对照来源等,源站未提供。CaseCCC 的完整名称与含义,源站未提供。

【适用场景】

源站未提供该数据集的具体适用场景说明。作为 cbioportal.org 上的肿瘤 / 其他类别记录,并带有 coad 标签,它可用于在来源站中按结肠腺癌相关主题进行检索和浏览。全外显子测序与肿瘤/正常配对设计通常与肿瘤基因组变异探索相关,但这是通用背景,不代表该数据集已经提供特定分析结果或临床结论。若需确认其研究用途、分析目标和可回答的科学问题,应参考来源站页面以及 pmid:25583493 对应的原始文献;源站未提供更具体的适用场景描述。

【使用方法】

源站未提供该数据集的使用方法、下载方式、登录要求、数据访问级别、应用程序接口、分析流程、可视化选项、教程或版本更新说明。已知来源站为 cbioportal.org,用户可从该来源站查找对应标题的数据页面。数据集英文名和源站标题均为 Colon Adenocarcinoma (CaseCCC, PNAS 2015),带有 coad 标签,归入肿瘤 / 其他类别。关于是否可以批量下载、是否需要注册、是否有使用限制、如何导入本地分析工具,源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供质量评估、质控指标、覆盖度、缺失值、批次效应、样本重复、验证实验、偏倚评估或研究局限性说明。来源站描述中能够确认的范围是:该数据集涉及 29 例非裔美国人结肠癌,采用肿瘤/正常配对全外显子测序。关于样本量是否足够、人群代表性、数据完整性、临床注释充分性、是否适合特定统计比较,源站未提供。任何更深入的质量判断和限制说明,均需以来源站页面或 pmid:25583493 对应文献为准。

【引用与许可】

该数据集关联的文献标识为 pmid:25583493,标题中包含 PNAS 2015,来源站为 cbioportal.org。关于许可协议、使用条款、再分发条件、商业使用限制、引用格式、作者列表、期刊卷期页码、数据版权归属,源站未提供。若需正式引用或判断能否再利用,应核对来源站页面与 pmid:25583493 对应记录。数据集带有 coad 标签,归入肿瘤 / 其他类别,英文名为 cBioPortal: Colon Adenocarcinoma (CaseCCC, PNAS 2015)。

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使用方式

数据集获取

源站:https://cbioportal.org/study/summary?id=coad_caseccc_2015

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

29例非裔美国人结肠癌肿瘤/正常配对样本的全外显子组测序。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

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