cBioPortal:乳腺浸润性癌(TCGA,PanCancer Atlas)
数据基于 TCGA PanCancer 项目,主题标签为 brca,可用于乳腺癌相关研究。源站未提供样本量、数据类型、字段结构、采集时间及使用许可等细节,具体信息需访问 cbioportal.org 查看(来源 cBioPortal)

基本信息
资源简介
cBioPortal:乳腺浸润性癌(TCGA,PanCancer Atlas)
cBioPortal 收录的 Breast Invasive Carcinoma (TCGA, PanCancer Atlas) 是一个面向乳腺癌浸润性癌研究的公开数据集,英文全称为 cBioPortal: Breast Invasive Carcinoma (TCGA, PanCancer Atlas)。该数据集源自 TCGA PanCancer 项目,主题标签为 brca,可用于乳腺癌相关研究。源站对其描述较为简洁,仅说明这是乳腺癌浸润性癌的 TCGA PanCancer 数据,并提供了原始数据与相关出版物的指向链接。就目前可获取的信息而言,源站未提供样本量、数据类型、字段结构、采集时间及使用许可等细节,因此如需了解更具体的内容,需访问 cbioportal.org 查看。整体上,该数据集适合作为乳腺癌分子与临床研究的一个入口资源,但其详细构成与使用条件仍需以源站页面为准。
【数据集背景】
该数据集来自 cbioportal.org,标题为 Breast Invasive Carcinoma (TCGA, PanCancer Atlas),属于 TCGA PanCancer 项目的一部分。TCGA PanCancer Atlas 是 TCGA 数据的一个整合性集合,旨在跨癌种进行统一分析。该数据集聚焦于乳腺浸润性癌,主题标签为 brca,表明其与乳腺癌研究直接相关。源站描述提到“Breast Invasive Carcinoma TCGA PanCancer data”,并给出原始数据与出版物的链接位置,但未进一步展开项目背景、发起机构或具体研究目标。
【数据内容】
源站未提供该数据集的具体数据内容细节,包括样本量、数据类型(如突变、拷贝数、表达、临床信息等)、字段结构或数据格式。已知信息仅表明其属于 TCGA PanCancer 数据,主题为乳腺浸润性癌。因此,无法从现有信息中确认该数据集包含哪些组学层面或临床变量。若需了解数据内容,应访问 cbioportal.org 上对应的数据集页面。
【采集与来源】
该数据集来源站为 cbioportal.org,源站描述中提供了原始数据与出版物的指向链接。数据基于 TCGA PanCancer 项目,但源站未提供具体的采集时间、采集地点、样本纳入标准或数据处理流程。DOI 信息以 pmid 形式列出,包括 pmid:29625048、29596782、29622463、29617662、29625055、29625050、29617662、30643250、322,这些指向相关出版物,但源站未说明各出版物与数据集的具体对应关系。
【适用场景】
该数据集主题标签为 brca,可用于乳腺癌相关研究。由于基于 TCGA PanCancer 项目,它可能适用于跨癌种比较或乳腺癌的分子特征探索等场景。然而,源站未提供样本量、数据类型、字段结构等细节,因此无法进一步明确其适用的具体分析类型,例如是否适合生存分析、突变频谱分析或药物靶点研究。使用者应结合源站页面提供的信息判断其适用性。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法,包括访问方式、下载格式、API 接口或分析工具。已知其来源站为 cbioportal.org,该平台通常提供在线探索与数据下载功能,但针对该数据集的具体操作步骤、是否需要注册或遵守特定条款,源站未在给定信息中说明。建议直接访问 cbioportal.org 查看该数据集页面以获取使用指引。
【质量与限制】
源站未提供该数据集的质量评估信息,例如数据完整性、准确性、批次效应或缺失值处理等。同时,源站未提供使用许可、访问限制或伦理审查相关信息。已知限制包括:源站描述非常简短,未提供样本量、数据类型、字段结构、采集时间及使用许可等细节。因此,在未访问源站的情况下,无法对该数据集的质量与限制做出具体判断。
【引用与许可】
该数据集列出了多个 pmid 作为 DOI 信息,包括 pmid:29625048、29596782、29622463、29617662、29625055、29625050、29617662、30643250、322。这些指向相关出版物,但源站未说明具体的引用格式或推荐引用方式。关于使用许可,源站未提供任何许可信息,包括是否允许商业使用、是否需要署名或是否有限制性条款。使用者应访问 cbioportal.org 查看该数据集页面的许可与引用说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://cbioportal.org/study/summary?id=brca_tcga_pan_can_atlas_2018
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Breast Invasive Carcinoma TCGA PanCancer data. The original data is here . The publications are here .
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




