犬类皮肤肿瘤组织学数据集(CATCH)

犬类皮肤肿瘤组织学数据集,含350张全切片图像、7种亚型及12424个标注,用于肿瘤分类和组织分割。

埃尔朗根-纽伦堡大学计算机科学系模式识别实验室埃尔朗根-纽伦堡大学计算机科学系模式识别实验室
arXiv
2022-08-26 更新
浏览 23
医学影像犬类皮肤肿瘤组织学图像
CAnine cuTaneous Cancer Histology (CATCH) dataset

基本信息

模态
医学影像
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2022-08-26

资源简介

犬类皮肤肿瘤组织学数据集(CATCH)

【数据集背景】

本数据集源站标题为《CAnine CuTaneous Cancer Histology Dataset》。源站首次发布:2022。

【数据内容】

源站原始描述:We present a large-scale dataset of 350 histologic samples of seven different canine cutaneous tumors. All samples were obtained through surgical resection due to neoplastic indicators and were selected retrospectively from the biopsy archive of the Institute for Veterinary Pathology of the Freie Universität Berlin according to sufficient tissue preservation and presence of characteristic histologic features for the corresponding tumor subtypes. Samples were stained with a routine Hematoxylin &…

【适用方向】

影像类数据可用于医学图像分析模型(检测、分割、分类)的训练与评测,也可用于标注质量与成像参数相关性的研究。

【获取与许可】

源站页面:https://www.cancerimagingarchive.net/collection/catch/

使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://doi.org/10.7937/TCIA.2M93-FX66

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

CATCH数据集由德国埃尔朗根-纽伦堡大学计算机科学系模式识别实验室和柏林自由大学兽医病理学研究所合作创建,专注于犬类皮肤肿瘤的组织学图像。包含350张完整切片图像,涵盖7种不同皮肤肿瘤亚型,并附有12,424个多边形标注,涉及13种组织类型。数据用于肿瘤亚型分类和组织分割任务,也可用于比较人类和犬类肿瘤的组织学相似性。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。