不同族裔人群中的癌症基因检测

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT04475640

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：乳腺癌、原发灶不明癌、中枢神经系统癌、消化系统癌、泌尿生殖系统癌、头颈部癌、恶性脑肿瘤、恶性女性生殖系统肿瘤。主要目的：I. 确定在梅奥诊所亚利桑那州和梅奥诊所佛罗里达州癌症诊所寻求治疗的不同种族癌症患者中基因突变的患病率。次要目的：I. 进行病历审查，以评估基因检测作为肿瘤治疗标准一部分的影响：Ia. 确定通过多基因面板检测发现的致病性生殖系突变的患病率。Ib. 确定这些患者中生殖系突变检测与传统指南（美国国家综合癌症网络[NCCN]）基于方法的遗传评估之间的差异。大纲：患者接受血液或唾液样本采集以进行基因检测。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。