HCC与PDAC患者TAPS样本数据集
该数据集来源于omicsdi.org,包含HCC与PDAC患者的TAPS检测样本,共涉及21例HCC患者、23例PDAC患者、30例非癌症对照、4例肝硬化患者及7例胰腺炎患者

基本信息
资源简介
HCC与PDAC患者TAPS样本数据集
该数据集收录于 omicsdi.org,分类归属于肿瘤 / 其他方向,主题标签为 Genomics。从样本构成来看,数据集围绕消化系统肿瘤及相关良性病变展开,涵盖肝细胞癌(HCC)与胰腺导管腺癌(PDAC)两类恶性肿瘤患者,同时纳入非癌症对照以及肝硬化和胰腺炎患者,形成具有一定对照层次的样本集合。数据集英文名称为 a14552e5-c220-4f81-ad41-dacb93c09482 - samples。整体而言,该数据集以 TAPS 检测数据为核心内容,涉及多类疾病状态与对照人群,可用于围绕 HCC、PDAC 及其相关非肿瘤性疾病的基因组学观察与分析,为肿瘤相关研究提供样本层面的数据基础。
【数据集背景】
该数据集来源于 omicsdi.org,所属分类为肿瘤 / 其他,主题标签为 Genomics。其样本覆盖 HCC 与 PDAC 两类肿瘤患者,并同时包含非癌症对照、肝硬化患者及胰腺炎患者。这一构成使其处于肿瘤基因组学与消化系统疾病研究的交叉位置。HCC 与 PDAC 均为消化系统常见恶性肿瘤,而肝硬化与胰腺炎则分别与肝脏和胰腺的慢性炎症及病变状态相关。将肿瘤患者、癌前或良性病变人群以及非癌症对照共同纳入同一数据集,有助于在比较视角下观察不同疾病状态之间的样本特征。数据集英文名称中的 “samples” 提示其内容以样本为单位组织,适合从样本层面开展后续分析。
【数据内容】
数据集的核心内容是来自多类人群的 TAPS 数据。具体而言,包括 21 例 HCC 患者的样本、23 例 PDAC 患者的样本、30 例非癌症对照样本、4 例肝硬化患者的样本以及 7 例胰腺炎患者的样本。上述样本共同构成该数据集的主体。主题标签为 Genomics,表明数据与基因组学相关。除这些样本数量与疾病类型信息外,源站未提供关于具体检测指标、数据文件格式、数据规模、变量字段或衍生结果的进一步说明。因此,数据内容在细节层面仍以源站描述所覆盖的范围为准。
【采集与来源】
该数据集来源站为 omicsdi.org。源站描述指出,数据为来自 21 例 HCC 患者、23 例 PDAC 患者、30 例非癌症对照、4 例肝硬化患者以及 7 例胰腺炎患者的 TAPS 数据。关于样本采集地点、采集时间、采集流程、伦理审批信息、受试者招募方式以及样本处理细节,源站未提供。数据集的英文名称为 a14552e5-c220-4f81-ad41-dacb93c09482 - samples,本站分类为肿瘤 / 其他,主题标签为 Genomics。
【适用场景】
基于现有信息,该数据集适用于与 HCC、PDAC 相关的基因组学分析场景,也可用于涉及非癌症对照、肝硬化及胰腺炎样本的比较性研究。由于数据集同时包含肿瘤患者与多种非肿瘤状态人群,潜在使用方向包括样本层面的分组比较、疾病状态相关特征探索,以及围绕消化系统肿瘤与良性病变的基因组学观察。主题标签 Genomics 进一步表明其可服务于基因组学相关研究。需要说明的是,源站未提供该数据集在具体研究问题、分析流程或验证目标上的限定,因此适用场景应结合使用者自身研究设计加以判断。
【使用方法】
该数据集以样本集合形式呈现,英文名称中包含 “samples”。使用者可依据 HCC、PDAC、非癌症对照、肝硬化及胰腺炎等分组信息,对样本进行分组管理与分析。由于主题标签为 Genomics,使用时可将其纳入基因组学数据处理流程。关于数据下载方式、文件组织方式、配套元数据表、分析工具或预处理步骤,源站未提供。因此,具体使用方法需以源站实际提供的数据访问与说明信息为准。
【质量与限制】
该数据集明确给出了各类样本的数量:21 例 HCC、23 例 PDAC、30 例非癌症对照、4 例肝硬化及 7 例胰腺炎。样本总量与分组信息较为清晰,但肝硬化组和胰腺炎组样本量相对较少。源站未提供关于数据完整性、测序深度、覆盖度、批次效应、缺失值、质控标准或验证结果的信息。此外,源站未提供受试者人口学信息、临床分期、治疗背景或随访信息。因此,在解释与使用该数据集时,应充分考虑这些未提供信息所带来的限制,避免超出数据实际覆盖范围作出推断。
【引用与许可】
该数据集来源站为 omicsdi.org。关于引用方式、许可协议、使用条款、数据共享政策以及原始出版物信息,源站未提供。使用者如需引用或再利用该数据集,应直接查阅来源站的相关说明,并遵循其发布的使用与许可要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001006871
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
来自21名HCC患者、23名PDAC患者、30名非癌症对照组、4名肝硬化患者和7名胰腺炎患者的TAPS数据。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




