DNA损伤应答样表型定义三分之一早发性结肠癌:补充数据
该补充数据对应手稿《一种DNA损伤应答样表型定义三分之一初诊结肠癌》。约三分之一的初诊结直肠癌在无凋亡或衰老相关p21/CDKN1A的情况下,显示γH2AX、pCHK2、pNBS1阳性灶,此表型类似正在进行的DNA损伤应答(DDR)

基本信息
资源简介
DNA损伤应答样表型定义三分之一早发性结肠癌:补充数据
A DNA damage response-like phenotype defines a third of colon cancers at onset. Supplementary data.
该补充数据对应手稿《一种DNA损伤应答样表型定义三分之一初诊结肠癌》。约三分之一的初诊结直肠癌在无凋亡或衰老相关p21/CDKN1A的情况下,显示γH2AX、pCHK2、pNBS1阳性灶,此表型类似正在进行的DNA损伤应答(DDR)。TP53状态、20q扩增或微卫星不稳定基因状态与该DDR表型不相关,仅与MSH2/MSH6失活及MLH1保守有优先关联。DDR相关基因的其他病变可能负责此表型,该表型在本队列其余病例中缺失。接受DNA损伤性药物辅助治疗后的结局未将该组与其余病例区分开。DDR+结直肠癌或可通过靶向DDR实现个体化治疗(来源 DOI 解析)。
【数据集背景】
源站首次发布:2023。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):这些是题为《一种类似DNA损伤反应的表达表型定义了结肠癌的一个新亚群》的手稿的补充数据。三分之一的结直肠癌初发表现显示,在没有凋亡或衰老相关p21/CDKN1A的情况下,出现γH2AX、pCHK2、pNBS1阳性灶。这种表型让人联想到正在进行的DNA损伤反应(DDR)。TP53状态、染色体20q扩增或微卫星不稳定基因状态与DDR表型不相关,除了与MSH2/MSH6失活和MLH1保守有优先关联。DDR相关基因的其他病变可能是导致这种表型的原因,而该表型在本队列其余病例中不存在。接受DNA损伤药物辅助治疗后的结果并未将该组与其余病例区分开来。DDR+结直肠癌可能适合通过靶向DDR进行个性化治疗。
【主题与分类】
主题标签:Pathology、Bioinformatics、Colon Cancer、Immunocytochemistry、DNA Damage、Personalized Therapy。本站分类:肿瘤/其他。
【获取与许可】
源站页面:https://data.mendeley.com/datasets/r9927r57bw/2
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://doi.org/10.17632/r9927r57bw.2
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 18.93 GB。
数据说明
这些是题为《一种类似DNA损伤反应的表达表型定义了结肠癌的一个新亚群》的手稿的补充数据。三分之一的结直肠癌原发表现显示,在缺乏凋亡或衰老相关p21/CDKN1A的情况下,出现γH2AX、pCHK2、pNBS1阳性灶。该表型让人联想到正在进行的DNA损伤反应(DDR)。TP53状态、染色体20q扩增或微卫星不稳定基因状态与DDR表型不相关,除了与MSH2/MSH6失活及MLH1保守有优先关联外。DDR相关基因的其他病变可能是该表型的原因,而该表型在本队列其余病例中不存在。接受DNA损伤药物辅助治疗后的结局并未将该组与其余病例区分开来。DDR+结直肠癌可能适合通过靶向DDR进行个体化治疗。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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