7例男性食管腺癌患者全外显子与RNASeq原始测序数据

资源简介

7例男性食管腺癌患者全外显子与RNASeq原始测序数据

该数据集收录于 omicsdi.org，英文名称为“81d05d99-8394-44a2-befd-5d1d489a1a2a - samples”，在本站分类中归入肿瘤 / 其他类别，主题标签为 Genomics。数据集包含 7 例男性食管腺癌患者全外显子测序与 RNA 测序的原始测序数据，诊断时中位年龄为 68 岁，用于测序的样本为肿瘤组织与 PBMC。该数据由一项由 Cancer Research UK Centres Network Accelerator Award Grant（A21998）资助的研究产生。整体而言，这是一份面向食管腺癌基因组与转录组研究的原始测序数据资源，适合围绕男性食管腺癌队列开展全外显子与转录组层面的分析工作。

【数据集背景】

该数据集来源于 omicsdi.org，属于肿瘤 / 其他分类，主题标签为 Genomics。其产生背景是一项由 Cancer Research UK Centres Network Accelerator Award Grant（A21998）资助的研究。数据集聚焦于食管腺癌这一肿瘤类型，纳入的是一个由 7 例男性患者组成的队列，诊断时中位年龄为 68 岁。从研究设计看，该数据集同时覆盖全外显子测序与 RNA 测序两类数据，并配套采集了肿瘤组织与 PBMC 两类样本，为在同一个患者队列中比较肿瘤组织与胚系来源材料提供了数据基础。

【数据内容】

数据集包含 7 例男性食管腺癌患者的全外显子测序与 RNA 测序原始测序数据。测序所使用的样本类型为肿瘤组织与 PBMC。数据以原始测序数据的形式提供，而非经过比对、变异检出或表达定量等处理后的结果文件。除上述信息外，源站未提供关于文件数量、数据总量、测序平台、读长、测序深度、覆盖度以及 RNA 测序具体建库方式等更细化的内容。

【采集与来源】

该数据集来自 omicsdi.org。队列由 7 例男性食管腺癌患者组成，诊断时中位年龄为 68 岁。样本来源为患者的肿瘤组织与 PBMC，二者分别用于全外显子测序和 RNA 测序。数据由一项受 Cancer Research UK Centres Network Accelerator Award Grant（A21998）资助的研究产生。关于样本采集的具体时间、地点、机构、伦理审批信息以及患者纳入排除标准，源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息，该数据集可用于食管腺癌的全外显子与转录组层面的研究，例如在肿瘤组织与 PBMC 之间开展胚系与体细胞层面的对照分析，或结合全外显子与 RNA 测序数据考察同一患者队列中的基因组变异与基因表达特征。由于队列明确为男性患者且诊断时中位年龄为 68 岁，该数据也适合用于围绕这一特定人群特征开展的探索性分析。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性，源站未提供进一步说明。

【使用方法】

该数据集提供的是原始测序数据，使用前通常需要经过质控、比对、变异检出或表达定量等常规处理流程。由于源站未提供测序平台、读长、建库方式及样本与文件的对应关系等细节，具体的处理参数与流程需依据实际获得的数据情况确定。关于数据下载方式、文件组织结构和配套元数据，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集的样本量为 7 例男性患者，属于小规模队列，在统计推断与结果外推方面存在固有局限。数据集仅包含男性患者，未涵盖女性人群。数据以原始测序数据形式提供，使用方需自行完成后续处理与质量控制。关于测序质量指标、覆盖度、重复样本、批次效应以及数据完整性等信息，源站未提供。

【引用与许可】

该数据产生于一项由 Cancer Research UK Centres Network Accelerator Award Grant（A21998）资助的研究。关于数据的具体引用方式、发表文献、许可条款与使用限制，源站未提供。