PCNSL肿瘤19例样本RNA测序数据集

该数据集包含来自PCNSL肿瘤的19个样本的RNA测序数据,测序在HiSeq X Ten平台上使用Illumina TruSeq Stranded mRNA Kit完成,且测序均为双端

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基因组分类Genomics
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基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

PCNSL肿瘤19例样本RNA测序数据集

该数据集收录了来自PCNSL肿瘤的RNA测序数据,共包含19个样本。测序工作依托Illumina TruSeq Stranded mRNA Kit完成,并在HiSeq X Ten平台上进行,所有测序均采用双端模式。从分类角度看,该数据集归属于肿瘤领域的其他类别,主题标签为基因组学,来源站为omicsdi.org。整体而言,这是一批围绕原发中枢神经系统淋巴瘤样本展开的转录组测序数据,可用于观察肿瘤样本中的基因表达信息。由于样本数量有限,其覆盖范围相对集中,适合作为特定研究场景下的数据资源使用。以下将从数据集背景、数据内容、采集与来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。

【数据集背景】

该数据集的主题标签为基因组学,本站分类为肿瘤 / 其他,来源站为omicsdi.org。从源站描述可知,其研究对象为PCNSL肿瘤,即原发中枢神经系统淋巴瘤。此类肿瘤在临床和基础研究中具有特定关注价值,而RNA测序能够从转录组层面反映样本的基因表达状态。该数据集以19个PCNSL肿瘤样本为对象,提供了相应的RNA测序信息,属于肿瘤基因组学数据资源的一部分。关于该数据集更具体的项目背景、研究目的、所属课题或资助信息,源站未提供。

【数据内容】

该数据集包含来自PCNSL肿瘤的19个样本的RNA测序数据。测序在HiSeq X Ten平台上使用Illumina TruSeq Stranded mRNA Kit完成,且测序均为双端。数据内容以RNA测序结果为核心,围绕19个肿瘤样本展开。主题标签为基因组学,本站分类为肿瘤 / 其他。关于样本的具体临床信息、分组方式、表达矩阵、原始数据文件列表、注释文件或衍生分析结果,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为omicsdi.org。根据源站描述,测序工作使用Illumina TruSeq Stranded mRNA Kit,并在HiSeq X Ten平台上完成,所有测序均为双端。研究对象为PCNSL肿瘤,共19个样本。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、患者知情同意情况以及具体建库流程的更多细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与PCNSL肿瘤相关的RNA测序分析场景,可用于转录组层面的探索性研究。由于其主题标签为基因组学,且本站分类为肿瘤 / 其他,因此可服务于肿瘤基因组学、基因表达分析等方向。具体而言,研究人员可将其作为PCNSL样本RNA测序数据的参考来源之一,用于表达谱观察、样本间比较或方法学验证等用途。关于该数据集是否适用于特定临床诊断、预后判断或治疗指导,源站未提供。

【使用方法】

该数据集来源于omicsdi.org,包含19个PCNSL肿瘤样本的RNA测序数据,测序平台为HiSeq X Ten,建库试剂为Illumina TruSeq Stranded mRNA Kit,测序方式为双端。使用时可依据这些信息进行数据检索、下载与后续分析。关于具体的下载方式、数据格式、访问权限、是否需要申请、分析流程或推荐工具,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集包含19个样本,样本数量相对有限。测序在HiSeq X Ten平台上使用Illumina TruSeq Stranded mRNA Kit完成,且均为双端测序,这些信息为数据的基本技术特征。关于数据质量评分、测序深度、读长、比对率、污染评估、批次效应或缺失值情况,源站未提供。因此,在使用该数据集时,应结合自身研究目的评估其适用性,并注意样本量有限可能带来的限制。

【引用与许可】

该数据集的来源站为omicsdi.org。关于引用方式、许可协议、使用条款、数据共享政策或版权归属,源站未提供。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001011119

标准获取流程:

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

对19份PCNSL肿瘤样本进行了RNA测序。测序使用Illumina TruSeq Stranded mRNA Kit在HiSeq X Ten平台上进行。测序均为双端。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

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