滤泡样甲状腺病变全外显子测序样本数据集

该数据集来自 omicsdi.org,围绕滤泡样甲状腺病变的基因组差异展开,包含对人类活检样本进行的全外显子测序实验,样本类型涵盖结节性增生、滤泡性甲状腺腺瘤、滤泡性甲状腺癌以及滤泡型甲状腺乳头状癌

omicsdi
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基因组分类Genomics
4821f088-6b32-488c-a230-a92f81c20114 - samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

滤泡样甲状腺病变全外显子测序样本数据集

该数据集围绕滤泡样甲状腺病变的基因组差异展开,旨在通过全外显子测序手段,对不同类型甲状腺滤泡样病变之间的基因组特征进行比较研究。数据集来源于 omicsdi.org,主题标签为 Genomics,本站分类归入肿瘤 / 其他。其研究对象为人类活检样本,涵盖结节性增生、滤泡性甲状腺腺瘤、滤泡性甲状腺癌以及滤泡型甲状腺乳头状癌等类型。整体而言,该数据集为探索滤泡样甲状腺病变在基因组层面的异同提供了测序数据基础,适用于甲状腺肿瘤相关的基础研究与分子特征分析。

【数据集背景】

甲状腺滤泡样病变包含多种病理类型,其临床行为与分子特征存在差异。为刻画不同类型滤泡样甲状腺病变之间的基因组差异,该数据集通过全外显子测序实验对相关人类活检样本进行研究。数据集英文名称为 4821f088-6b32-488c-a230-a92f81c20114 - samples,来源站为 omicsdi.org,主题标签为 Genomics,本站分类为肿瘤 / 其他。其核心目标在于从基因组层面区分和描述结节性增生、滤泡性甲状腺腺瘤、滤泡性甲状腺癌以及滤泡型甲状腺乳头状癌等病变类型。

【数据内容】

该数据集的内容基于全外显子测序实验,实验对象为人类活检样本。样本类型涵盖结节性增生、滤泡性甲状腺腺瘤、滤泡性甲状腺癌以及滤泡型甲状腺乳头状癌。数据集的主题标签为 Genomics,表明其数据内容属于基因组学范畴。关于具体的样本数量、测序深度、变异位点数目、数据文件格式或存储大小等信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org。其数据产生方式为对人类活检样本进行全外显子测序实验,所涉及的样本对应结节性增生、滤泡性甲状腺腺瘤、滤泡性甲状腺癌以及滤泡型甲状腺乳头状癌等滤泡样甲状腺病变类型。关于样本采集的具体机构、采集时间、地理区域、伦理审批信息或临床随访信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于围绕滤泡样甲状腺病变基因组差异展开的研究场景,例如比较不同类型甲状腺滤泡样病变在全外显子层面的基因组特征,或用于甲状腺肿瘤分子机制探索中的候选基因与变异筛选。其主题标签 Genomics 及本站分类肿瘤 / 其他,也提示其可服务于肿瘤基因组学相关分析。关于具体的分析流程、推荐工具或验证实验设计,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可用于全外显子测序数据的二次分析,例如对结节性增生、滤泡性甲状腺腺瘤、滤泡性甲状腺癌及滤泡型甲状腺乳头状癌等样本的测序结果进行基因组差异比较。使用者可根据研究目的,围绕滤泡样甲状腺病变的分类与分子特征开展分析。关于数据下载方式、访问链接、文件组织格式、预处理步骤或分析参数,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集基于人类活检样本的全外显子测序实验,样本类型覆盖结节性增生、滤泡性甲状腺腺瘤、滤泡性甲状腺癌以及滤泡型甲状腺乳头状癌。关于数据质量指标、覆盖度、重复性、批次效应、样本量大小或潜在偏倚等信息,源站未提供。使用时应结合具体研究问题评估其适用性。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款或授权信息,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001008022

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集旨在表征不同类型滤泡样甲状腺病变之间的基因组差异。为此,我们对来自结节性增生、滤泡性甲状腺腺瘤、滤泡性甲状腺癌及滤泡变异型甲状腺乳头状癌的人类活检样本进行了全外显子测序实验。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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