化疗初治与化疗后PDAC肿瘤配对RNA-Seq样本
该数据集为32例化疗初治与化疗后PDAC肿瘤的配对RNA-Seq样本，用于界定新辅助化疗的分子和细胞影响。转录组分析结合全组织切片高分辨率映射，识别出GATA6（Classical）、KRT17（Basal-like）和细胞色素P450 3A（CYP3A）共表达细胞，这些细胞在化疗后切除样本中优先富
基本信息
资源简介
化疗初治与化疗后PDAC肿瘤配对RNA-Seq样本
该数据集为32例化疗初治与化疗后PDAC肿瘤的配对RNA-Seq样本，用于界定新辅助化疗的分子和细胞影响。转录组分析结合全组织切片高分辨率映射，识别出GATA6（Classical）、KRT17（Basal-like）和细胞色素P450 3A（CYP3A）共表达细胞，这些细胞在化疗后切除样本中优先富集。测序在HiSeq2000/HiSeq2500上完成，使用Takara_SMARTer_Ultra_Low_Input_RNA_and_NEBNext_ChIP-Seq Kit。可用于研究化疗对PDAC转录组和细胞组成的影响（来源 omicsdi.org）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：32例化疗初治和化疗后PDAC肿瘤的配对RNA-Seq（HIPO_015），用于界定新辅助化疗的分子和细胞影响。转录组分析结合全组织切片的高分辨率映射，识别出GATA6（Classical）、KRT17（Basal-like）和细胞色素P450 3A（CYP3A）共表达细胞，这些细胞在化疗后切除样本中优先富集。测序在HiSeq2000/HiSeq2500上完成，使用Takara_SMARTer_Ultra_Low_Input_RNA_and_NEBNext_ChIP-Seq Kit。
【主题与分类】
主题标签：Genomics。本站分类：肿瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001010884
下载信息
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源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001010884
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
32例初治和化疗后PDAC肿瘤样本的配对RNA测序（HIPO_015），以确定新辅助化疗的分子和细胞影响。转录组分析结合全组织切片的高分辨率定位，识别出GATA6（经典型）、KRT17（基底样型）和细胞色素P450 3A（CYP3A）共表达细胞，这些细胞在化疗后切除样本中优先富集。测序使用HiSeq2000/HiSeq2500平台，采用Takara_SMARTer_Ultra_Low_Input_RNA_and_NEBNext_ChIP-Seq试剂盒完成。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
