GSE125399 鼻内翻性乳头状瘤恶变甲基化数据集
该 GEO 数据集比较鼻腔鼻窦内翻性乳头状瘤与其恶变为鳞状细胞癌后的全基因组 DNA 甲基化差异。由Beijing Tongren Hospital提供，来自Gene Expression Omnibus，数据格式为表格，包含11条数据记录，适用于分类任务，专注于肿瘤领域的鼻腔与鼻窦肿瘤研究。
基本信息
资源简介
GSE125399 鼻内翻性乳头状瘤恶变甲基化数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Putative Biomarkers of malignant transformation of sinonasal inverted papilloma into squamous cell carcinoma》。源站首次发布：Jan 21 201。
【数据内容】
源站原始描述：OBJECTIVE: Although the malignant transformation of sinonasal inverted papilloma (SNIP) into squamous cell carcinomas (SCC) has been reported in the literature, the molecular mechanisms driving this transformation have not been elucidated. This study compares genome-wide DNA methylation between SNIP and SCC arising in SNIP and further validates the expression of aberrantly methylated genes
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签：Methylation profiling by array、GPL13534、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE125399
【使用注意】
· 源站最后修改于 Mar 22 201，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE125399
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该 GEO 数据集比较鼻腔鼻窦内翻性乳头状瘤与其恶变为鳞状细胞癌后的全基因组 DNA 甲基化差异。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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