GSE288828：XPO1过表达驱动Eprenetapopt和阿扎胞苷耐药，并可作为TP53突变髓系恶性肿瘤的治疗靶点
TP53 突变（TP53mt）与髓系恶性肿瘤的化疗难治性及中位生存期不足 6 个月相关。目前亟需建立临床前模型并理解对当前次优疗法的耐药机制
基本信息
资源简介
GSE288828：XPO1过表达驱动Eprenetapopt和阿扎胞苷耐药，并可作为TP53突变髓系恶性肿瘤的治疗靶点
GSE288828 数据集围绕 TP53 突变（TP53mt）髓系恶性肿瘤的治疗耐药问题展开。TP53 突变与化疗难治性以及中位生存期不足 6 个月相关，临床上亟需建立临床前模型并理解对当前次优疗法的耐药机制。在两项将 eprenetapopt 与阿扎胞苷联合使用的临床试验中，虽然观察到较高的缓解率，但复发不可避免。该数据集对应的工作建立了 TP53 突变骨髓增生异常综合征（MDS）的新型临床前模型，并通过全基因组 CRISPR 筛选发现 XPO1 是该疗法耐药的介导因子，进而证明 XPO1 在 eprenetapopt 和阿扎胞苷治疗后过表达，阐明其发生机制，并确定 XPO1 对该疗法及其他 TP53mt 再激活疗法的耐药既是必要的也是充分的，最后在 TP53mt MDS 的患者来源异种移植模型中进行了验证。
【数据集背景】
TP53 突变在髓系恶性肿瘤中与化疗难治性和极差的生存预后相关，中位生存期不足 6 个月。当前可用的治疗手段并不理想，eprenetapopt 联合阿扎胞苷的临床试验虽显示较高缓解率，但患者最终仍会复发。因此，建立能够模拟 TP53 突变 MDS 的临床前模型，并揭示其耐药机制，是亟待解决的临床与基础研究问题。该数据集正是针对这一未满足的需求而产生，其研究核心在于通过全基因组 CRISPR 筛选寻找耐药介导因子，并围绕 XPO1 展开机制与治疗转化研究。
【数据内容】
该数据集的内容涉及 TP53 突变髓系恶性肿瘤的临床前模型、全基因组 CRISPR 筛选、XPO1 在治疗后过表达的现象及其机制、XPO1 对耐药的必要性与充分性验证，以及患者来源异种移植模型的验证。具体的数据类型、样本数量、测序平台、文件格式等细节，源站未提供。
【采集与来源】
数据集英文名称为 GSE288828: XPO1 Over-expression Drives Resistance to Eprenetapopt and Azacitidine and can be Therapeutically Exploited in TP53 Mutated Myeloid Malignancies。来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。本站分类为肿瘤 / 骨髓增生异常综合征。其余关于样本采集地点、时间、伦理审批等具体来源信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于 TP53 突变髓系恶性肿瘤，尤其是骨髓增生异常综合征（MDS）相关的研究场景，包括：研究 eprenetapopt 与阿扎胞苷联合治疗的耐药机制；探索 XPO1 作为耐药介导因子的作用；利用全基因组 CRISPR 筛选发现治疗耐药相关靶点；在患者来源异种移植模型中验证候选靶点或治疗策略；以及为 TP53mt 再激活疗法的耐药研究提供临床前模型基础。其他潜在应用场景，源站未提供。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法，包括数据下载方式、分析流程、软件工具或代码等。
【质量与限制】
该数据集基于临床前模型、全基因组 CRISPR 筛选和患者来源异种移植模型，研究结论指向 XPO1 在耐药中的必要性与充分性。但关于数据质量指标、批次效应、样本量、统计效力、模型局限性等具体信息，源站未提供。此外，源站描述在“validate in a patient-derived xenograft model of TP53mt MDS t”处中断，后续内容不完整。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE288828
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
TP53突变（TP53mt）与髓系恶性肿瘤的化疗难治性及不足6个月的中位生存期相关。目前仍存在未被满足的需求：建立临床前模型并理解对当前次优疗法的耐药机制。在两项将eprenetapopt与阿扎胞苷联合使用的临床试验中，观察到较高的缓解率，但复发不可避免地发生。在此，我们构建了一种新的TP53mt骨髓增生异常综合征（MDS）临床前模型，并进行了全基因组CRISPR筛选，结果提示XPO1是该疗法耐药的介导因子。我们证明，在eprenetapopt和阿扎胞苷治疗后XPO1过表达，阐明其发生机制，并确定XPO1对于该疗法及其他TP53mt再激活疗法的耐药是必要且充分的。最后，我们在TP53mt MDS的患者来源异种移植模型中验证，eprenetapopt联合XPO1抑制剂可克服这种耐药，为TP53mt髓系恶性肿瘤患者提供了一种潜在的新治疗策略。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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