GSE206123 晚期蕈样肉芽肿单细胞RNA测序数据集

该数据集使用单细胞RNA测序刻画晚期蕈样肉芽肿皮肤肿瘤微环境,包含CTCL样本和正常皮肤样本。由University of Pittsburgh提供,来自Gene Expression Omnibus,数据格式为表格,包含12条数据记录,适用于分类任务。

University of PittsburghUniversity of Pittsburgh
Gene Expression Omnibus
2023-11-22 更新
浏览 17
表格分类GPL246769606
GSE206123

基本信息

模态
表格
大小
0.28 GB
数据量
12
任务类型
分类
创建/更新时间
2023-11-22

资源简介

GSE206123 晚期蕈样肉芽肿单细胞RNA测序数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Characterization of the cutaneous tumor microenvironment of advanced-stage mycosis fungoides using single-cell RNA sequencing》。源站首次发布:Jun 14 202。

【数据内容】

源站原始描述:Malignant T lymphocyte proliferation in mycosis fungoides (MF) is largely restricted to the skin, implying that malignant cells are dependent on their specific cutaneous tumor microenvironment (TME), including interactions with non-malignant immune and stromal cells, cytokines, and other immunomodulatory factors. To explore these interactions, we performed a comprehensive transcriptome analysis of the TME in advanced-stage MF skin tumors by single-cell RNA sequencing. Our analysis identified cel…

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by high throughput sequencing、GPL24676、9606。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE206123

【使用注意】

· 源站最后修改于 Nov 22 202,引用时请注意版本时效。

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源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE206123

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 0.28 GB。

数据说明

该数据集使用单细胞RNA测序刻画晚期蕈样肉芽肿皮肤肿瘤微环境,包含CTCL样本和正常皮肤样本。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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