一例髓外多发性骨髓瘤患者来源原位异种移植瘤的全DNA甲基化组
该数据集为一名53岁侵袭性髓外多发性骨髓瘤(EMM)患者来源的原位异种移植瘤(PDOX)的全DNA甲基化组数据,用于深入研究与髓外疾病相关的遗传和表观遗传事件及药物反应

基本信息
资源简介
一例髓外多发性骨髓瘤患者来源原位异种移植瘤的全DNA甲基化组
该数据集收录了一名53岁侵袭性髓外多发性骨髓瘤(EMM)患者来源的原位异种移植瘤(PDOX)的全DNA甲基化组数据。髓外多发性骨髓瘤是多发性骨髓瘤中侵袭性较强、预后较差的一种表现形式,其遗传与表观遗传机制尚未被充分阐明。该数据集通过对EMM PDOX的全DNA甲基化组进行评估,并将其与已发表的101例新诊断、未接受化疗的多发性骨髓瘤患者及正常浆细胞(NPC)数据集(Agirre等,2015)进行比较,观察到高甲基化与低甲基化位点比例较为均衡,这与既往报道中多发性骨髓瘤普遍存在广泛低甲基化的现象不同。该数据可用于深入研究与髓外疾病相关的遗传和表观遗传事件及药物反应,主题标签为转录组学,本站分类归入肿瘤/多发性骨髓瘤。
【数据集背景】
多发性骨髓瘤是一种浆细胞恶性肿瘤,而髓外多发性骨髓瘤(EMM)指骨髓瘤细胞侵犯骨髓外组织或器官,通常提示更强的侵袭性和更差的临床结局。为深入探究与髓外疾病相关的遗传和表观遗传事件以及药物反应,研究者构建了该患者来源的原位异种移植瘤(PDOX)模型。该模型来源于一名53岁的侵袭性EMM患者。在此基础上,研究者对EMM PDOX的全DNA甲基化组进行了评估,以刻画其表观遗传特征。该数据集正是围绕这一EMM PDOX的全DNA甲基化组展开,属于肿瘤/多发性骨髓瘤分类,主题标签为转录组学。
【数据内容】
该数据集的核心内容是一名53岁侵袭性髓外多发性骨髓瘤患者来源的原位异种移植瘤(PDOX)的全DNA甲基化组数据。研究者对该EMM PDOX的全DNA甲基化组进行了评估,并将其与一个已发表的数据集进行比较,该已发表数据集包含101例新诊断且未接受化疗的多发性骨髓瘤患者以及正常浆细胞(NPC)(Agirre等,2015)。通过比较,观察到高甲基化与低甲基化位点的比例较为均衡,这与既往报道中多发性骨髓瘤普遍存在广泛低甲基化的现象不同。数据集英文名称为Whole DNA methylome of an extramedullary multiple myeloma patient derived orthotopic xenograft。除上述内容外,源站未提供更细化的数据内容描述。
【采集与来源】
该数据来源于一名53岁侵袭性髓外多发性骨髓瘤患者,研究者由此生成了患者来源的原位异种移植瘤(PDOX)。该PDOX用于研究与髓外疾病相关的遗传和表观遗传事件及药物反应。全DNA甲基化组数据即基于该EMM PDOX进行评估。数据集的来源站为omicsdi.org。关于具体的样本采集流程、测序平台、建库方法、时间地点等细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究与髓外多发性骨髓瘤相关的表观遗传事件,尤其是全DNA甲基化层面的特征分析。由于研究者将其与101例新诊断、未接受化疗的多发性骨髓瘤患者及正常浆细胞(NPC)的数据集(Agirre等,2015)进行比较,该数据可用于探讨EMM与普通多发性骨髓瘤在甲基化模式上的差异,例如高甲基化与低甲基化位点的比例分布。此外,该PDOX模型本身用于研究药物反应,因此该数据集也可为与髓外疾病相关的药物反应研究提供表观遗传层面的参考。主题标签为转录组学,可服务于肿瘤/多发性骨髓瘤领域的相关分析。除上述用途外,源站未提供其他适用场景说明。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据下载方式、文件格式、分析流程、软件工具或代码等均未说明。使用者如需使用,应参考来源站omicsdi.org提供的相关信息。源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于单一一名53岁侵袭性髓外多发性骨髓瘤患者的PDOX,样本量有限。其比较对象为已发表的101例新诊断、未接受化疗的多发性骨髓瘤患者及正常浆细胞(NPC)数据集(Agirre等,2015)。研究者观察到该EMM PDOX中高甲基化与低甲基化位点比例较为均衡,与既往报道的多发性骨髓瘤广泛低甲基化不同。关于数据质量评估、批次效应、覆盖度、重复性等具体指标,源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。使用者应参考来源站omicsdi.org获取相关引用与许可要求。源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-10654
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
从一名患有53岁侵袭性髓外多发性骨髓瘤(EMM)的患者中,构建了患者来源的原位异种移植模型(PDOX),以深入研究与髓外疾病相关的遗传和表观遗传事件及药物反应。我们还评估了EMM PDOX的全DNA甲基化组,并将其与已发表的101名新诊断且未接受化疗的MM患者及正常浆细胞(NPC)的数据集(Agirre等,2015)进行了比较。观察到高甲基化/低甲基化位点的比例相当均衡,这与先前报道的MM中广泛低甲基化不同。
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