多发性骨髓瘤患者与健康供体扁桃体纯化浆细胞的RNAseq图谱

该数据集来源于omicsdi.org,收录了多发性骨髓瘤患者与健康供体扁桃体中纯化浆细胞的RNAseq表达谱。数据覆盖肿瘤与正常浆细胞两类样本,主题标签为Genomics,属于肿瘤/多发性骨髓瘤分类

omicsdi
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基因组分类Genomics
ena-DATASET-BLUEPRINT-16-01-2015-10:49:23:886-135 - samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

多发性骨髓瘤患者与健康供体扁桃体纯化浆细胞的RNAseq图谱

该数据集英文名称为 ena-DATASET-BLUEPRINT-16-01-2015-10:49:23:886-135 - samples,来源于 omicsdi.org,属于肿瘤 / 多发性骨髓瘤分类,主题标签为 Genomics。其源站描述为“RNAseq profile of purified plasma cells from multiple myeloma patients and tonsils of healthy donors”,即收录了来自多发性骨髓瘤患者以及健康供体扁桃体的纯化浆细胞的 RNAseq 表达谱。从整体上看,该数据集围绕浆细胞这一关键细胞类型,同时覆盖肿瘤与正常两类样本,为在多发性骨髓瘤背景下研究浆细胞的转录组特征提供了数据基础。其命名中包含样本(samples)相关信息,表明数据集以样本层面的表达谱资料为核心内容,适合用于比较肿瘤来源浆细胞与健康来源浆细胞之间的基因表达差异。

【数据集背景】

该数据集归属于肿瘤 / 多发性骨髓瘤这一分类,主题标签为 Genomics。多发性骨髓瘤是一种涉及浆细胞的肿瘤性疾病,而该数据集正是围绕多发性骨髓瘤患者与健康供体的浆细胞展开。源站描述明确指出,其内容为纯化浆细胞的 RNAseq 表达谱,样本来源包括多发性骨髓瘤患者以及健康供体的扁桃体。通过将肿瘤状态下的浆细胞与健康供体扁桃体中的浆细胞并列,该数据集在背景设计上具备肿瘤与正常对照相互参照的特点,有助于在转录组层面观察浆细胞在疾病状态下的表达变化。数据集的英文名称中包含 BLUEPRINT 字样以及具体时间标识,表明其可能属于某个更大型项目或批次中的样本集合,但关于该项目的具体背景、组织方式及科学目标,源站未提供。

【数据内容】

该数据集的核心内容是 RNAseq 表达谱,研究对象为纯化的浆细胞。样本覆盖两类来源:一是多发性骨髓瘤患者的浆细胞,二是健康供体扁桃体中的浆细胞。源站描述中“purified plasma cells”强调浆细胞经过纯化处理,这意味着数据所反映的表达谱应主要来自浆细胞本身,而非未分选的混合细胞群体。主题标签为 Genomics,说明该数据集属于基因组学范畴,具体表现为 RNAseq 这一转录组层面的表达信息。数据集名称中包含“samples”,提示其以样本为组织单位,可能包含多个样本的表达谱记录。关于样本数量、测序平台、读长、表达定量方式、基因注释版本等具体技术细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源站为 omicsdi.org。源站描述说明,样本来自多发性骨髓瘤患者以及健康供体的扁桃体,并经过浆细胞纯化后开展 RNAseq 表达谱分析。由此可知,样本采集涉及两类生物学来源:患者的浆细胞与健康供体扁桃体中的浆细胞。扁桃体作为健康供体浆细胞的来源组织,在源站描述中被明确提及;而多发性骨髓瘤患者的浆细胞则作为肿瘤样本来源。关于采集地点、采集时间、伦理审批信息、供体数量、患者临床特征、样本处理流程、RNA提取方法、建库方式及测序平台等,源站未提供。

【适用场景】

基于其内容,该数据集可用于多发性骨髓瘤相关的转录组研究,尤其是围绕浆细胞的基因表达分析。由于同时包含多发性骨髓瘤患者浆细胞与健康供体扁桃体浆细胞,该数据集适用于肿瘤与正常浆细胞之间的表达谱比较,可用于探索疾病状态下浆细胞表达特征的改变。主题标签 Genomics 表明其适用于基因组学或转录组学范畴的分析工作。此外,该数据集也可作为多发性骨髓瘤研究中浆细胞表达谱的参考数据,用于方法验证、表达模式观察或与其他浆细胞相关数据集进行整合分析的探索。关于具体的分析应用、研究假设或已验证的科学结论,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以样本形式组织,名称为 ena-DATASET-BLUEPRINT-16-01-2015-10:49:23:886-135 - samples,可通过来源站 omicsdi.org 获取。使用者可根据样本来源区分多发性骨髓瘤患者浆细胞与健康供体扁桃体浆细胞,进而开展 RNAseq 表达谱的对比分析。由于源站描述仅说明其为纯化浆细胞的 RNAseq 表达谱,未提供数据格式、下载方式、文件结构、预处理流程或分析工具建议,因此具体的使用方法、数据处理步骤及分析流程需依据源站实际提供的数据文件与说明进行操作。关于数据访问权限、下载链接、文件格式及配套元数据,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 omicsdi.org,源站描述明确其内容为多发性骨髓瘤患者与健康供体扁桃体纯化浆细胞的 RNAseq 表达谱。其样本类型覆盖肿瘤与正常两类,具备一定的对照比较基础。然而,关于样本量、测序深度、数据完整性、批次效应、质量控制指标、纯化效率验证、患者临床信息及健康供体特征等,源站未提供。因此,在缺乏这些具体信息的情况下,使用者难以对该数据集的质量、代表性及适用范围做出全面评估。此外,该数据集名称中包含具体时间标识,可能反映其属于某一批次或某一时点的样本集合,但其对数据代表性的影响,源站未提供说明。

【引用与许可】

该数据集来源站为 omicsdi.org,英文名称为 ena-DATASET-BLUEPRINT-16-01-2015-10:49:23:886-135 - samples。关于该数据集的引用方式、原始发表文献、数据许可协议、使用条款、版权归属及再分发限制,源站未提供。使用者在引用或使用该数据集时,应参考来源站 omicsdi.org 上对应的数据集页面以获取准确的引用与许可信息。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001001212

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

RNAseq profile of purified plasma cells from multiple myeloma patients and tonsils of healthy donors

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