ena-DATASET-BLUEPRINT-10-10-2013-10:03:28:124-485 样本集
该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤 / 多发性骨髓瘤分类,主题标签为 Genomics。源站描述显示,其内容为两个多发性骨髓瘤样本和一个浆细胞混合样本的全基因组亚硫酸氢盐测序

基本信息
资源简介
ena-DATASET-BLUEPRINT-10-10-2013-10:03:28:124-485 样本集
该数据集名为 ena-DATASET-BLUEPRINT-10-10-2013-10:03:28:124-485 - samples,来源于 omicsdi.org,在本站被归类于肿瘤 / 多发性骨髓瘤方向,主题标签为 Genomics。根据源站描述,该数据集的内容是对两个多发性骨髓瘤样本以及一个浆细胞混合样本进行全基因组亚硫酸氢盐测序。整体来看,它属于基因组学层面的测序数据集合,围绕多发性骨髓瘤这一血液系统肿瘤展开,涉及样本包括肿瘤样本与浆细胞混合样本,适合关注多发性骨髓瘤表观遗传特征、DNA 甲基化模式以及全基因组亚硫酸氢盐测序技术应用的研究人员参考。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制、引用与许可等方面进行介绍。
【数据集背景】
多发性骨髓瘤是一种来源于浆细胞的恶性肿瘤,其发生发展涉及复杂的遗传与表观遗传改变。全基因组亚硫酸氢盐测序是一种能够在全基因组范围内检测 DNA 甲基化状态的技术,常用于研究基因表达调控、肿瘤发生机制以及表观遗传标志物。该数据集正是在这一背景下产生,聚焦于多发性骨髓瘤样本与浆细胞混合样本的全基因组亚硫酸氢盐测序,主题标签为 Genomics,本站分类为肿瘤 / 多发性骨髓瘤。源站未提供该数据集的具体研究项目背景、所属联盟或更详细的疾病分期信息。
【数据内容】
根据源站描述,该数据集包含两个多发性骨髓瘤样本和一个浆细胞混合样本的全基因组亚硫酸氢盐测序数据。样本类型涉及多发性骨髓瘤样本与浆细胞混合样本,测序策略为全基因组亚硫酸氢盐测序。数据集名称中包含“samples”字样,提示其内容可能与样本层面的数据组织有关。除上述信息外,源站未提供样本的具体数量统计、测序深度、覆盖度、数据文件格式、文件大小、原始数据与处理后数据的区分等细节。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org,本站分类为肿瘤 / 多发性骨髓瘤,主题标签为 Genomics。数据集英文名称中包含日期与时间标识“10-10-2013-10:03:28:124-485”,可能用于标识数据集的生成或收录时间点,但源站未提供该标识的具体含义说明。源站未提供样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、受试者人口学特征、临床信息以及测序平台或试剂盒等具体采集与实验细节。
【适用场景】
基于其内容,该数据集可用于多发性骨髓瘤相关的表观遗传学研究,尤其是全基因组 DNA 甲基化分析。潜在应用包括:比较多发性骨髓瘤样本与浆细胞混合样本之间的甲基化差异;探索多发性骨髓瘤中异常甲基化区域;为表观遗传标志物筛选提供数据基础;以及作为基因组学研究中全基因组亚硫酸氢盐测序数据的参考。由于主题标签为 Genomics,该数据集也可用于基因组学方法学比较或数据整合分析。源站未提供该数据集的具体适用场景说明或推荐分析流程。
【使用方法】
该数据集来自 omicsdi.org,通常可通过该来源站获取或跳转至原始数据存储库。使用全基因组亚硫酸氢盐测序数据时,一般需要经过比对、甲基化位点识别、差异甲基化分析等步骤。但源站未提供该数据集的具体下载方式、文件组织格式、推荐分析工具、参考基因组版本以及预处理流程。因此,实际使用方法需结合源站或原始数据存储库提供的说明进行确认。
【质量与限制】
源站未提供该数据集的质量评估信息,包括测序质量分数、覆盖度、重复性、批次效应、样本纯度或混合样本组成比例等。由于仅包含两个多发性骨髓瘤样本和一个浆细胞混合样本,样本量较小,可能限制统计功效与结论的普适性。此外,源站未提供临床注释、随访信息或验证实验数据,因此该数据集在临床解释方面存在局限。使用时应关注样本量、混合样本设计以及缺乏质量指标等潜在限制。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式、许可协议、使用条款或数据访问限制。使用者在利用该数据集时,应自行查阅 omicsdi.org 及原始数据存储库的相关说明,确认是否需要获得授权、是否允许再分发以及如何正确引用。源站未提供具体许可信息,因此无法在此给出明确的引用格式或使用许可结论。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001000672
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Whole-genome Bisulfite sequencing of two multiple myeloma samples and one pooled sample of plasma cells.
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