超二倍体多发性骨髓瘤中特定miRNA的下调模拟非超二倍体亚型中IgH易位的致癌效应

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-40308

标准获取流程：

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数据说明

目前，多发性骨髓瘤（MM）患者大致可分为非超二倍体组（nh-MM），该组高度富集IgH易位，或超二倍体组（h-MM），其特征通常为某些奇数染色体的三体性。我们比较了这两组的miRNA表达谱，并鉴定出相对于nh-MM组，在h-MM组中有16个miRNA下调。我们发现，差异表达最显著的miRNA的靶基因直接参与MM的发病机制；具体而言，抑制在h-MM中均下调的hsa-miR-425、hsa-miR-152和hsa-miR-24会导致CCND1、TACC3、MAFB、FGFR3和MYC的过表达，这些也是nh-MM中最常见的IgH染色体易位所上调的癌基因。重要的是，我们发现这些特定miRNA的下调及其靶标的上调在原发性h-MM病例中也同时发生。这些数据进一步证明了细胞周期蛋白C通路失调作为参与两组MM发展的关键机制的统一作用。

最后，他们确立了miRNA失调在多发性骨髓瘤（MM）背景下的重要性，从而为基于这一分子机制的未来治疗途径开辟了可能性。miRNA表达谱分析：发现系列由53例CD138阳性的初诊多发性骨髓瘤原发病例组成，其中36例被分类为nh-MM，17例为h-MM。首次分析中还包括7个MM细胞系，六个（JJN3、L363、OPM-2、K620、KMS28BM、KMS28PE）代表nh-MM亚型，一个（OH-2）作为h-MM的模型。所有样本，包括原发病例和细胞系，均标记并双份杂交至‘8-pack’人类miRNA寡核苷酸微阵列G4470A（Agilent Technologies）。我们通过标准化生物信息学方法鉴定了nh-MM与h-MM亚型之间差异表达的miRNA。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。