BLUEPRINT 2016年8月多发性骨髓瘤 RNA-Seq 数据集(GRCh38)样本

该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤 / 多发性骨髓瘤分类,包含 14 个多发性骨髓瘤样本的 RNA-Seq 数据,基于人类基因组 GRCh38,共 14 个 run、14 个 experiment 和 14 个 analysis,是 BLUEPRINT 2016 年 8 月发布的一部分

omicsdi
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基因组分类Genomics
BP_August_2016_RNA-Seq_Multiple_Myeloma_on_GRCh38 - samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

BLUEPRINT 2016年8月多发性骨髓瘤 RNA-Seq 数据集(GRCh38)样本

该数据集为 BP_August_2016_RNA-Seq_Multiple_Myeloma_on_GRCh38 - samples,来源于 omicsdi.org,归类于肿瘤 / 多发性骨髓瘤方向,主题标签为 Genomics。其核心内容是 14 个多发性骨髓瘤样本的 RNA-Seq 数据,基于人类基因组 GRCh38 进行数据处理,并包含 14 个 run、14 个 experiment 和 14 个 analysis。该数据集是 BLUEPRINT 项目 2016 年 8 月发布成果的组成部分,可用于围绕多发性骨髓瘤转录组特征开展探索性分析。整体来看,该资源以样本数量明确、参考基因组版本清晰、数据层级完整为特点,适合作为肿瘤转录组研究中的公开数据入口之一。

【数据集背景】

多发性骨髓瘤是一种来源于浆细胞的恶性肿瘤,围绕其转录组开展研究有助于理解疾病相关基因表达特征。该数据集属于肿瘤 / 多发性骨髓瘤分类,主题标签为 Genomics,说明其定位在基因组学与肿瘤研究的交叉领域。数据集名称中包含 BP_August_2016_RNA-Seq_Multiple_Myeloma_on_GRCh38 - samples,表明其与 BLUEPRINT 项目 2016 年 8 月发布相关,并采用 RNA-Seq 技术路线,参考人类基因组 GRCh38。来源站为 omicsdi.org,该站作为数据索引与聚合平台,提供了该数据集的访问入口。源站描述指出,该数据是 BLUEPRINT 2016 年 8 月发布的一部分,并提供了分析文档链接,便于使用者进一步了解 RNA-Seq 分析流程与相关说明。

【数据内容】

该数据集包含 14 个多发性骨髓瘤样本的 RNA-Seq 数据。与样本数量相对应,数据集包含 14 个 run、14 个 experiment 和 14 个 analysis。数据基于人类基因组 GRCh38 进行组织与处理。RNA-Seq 数据通常用于反映样本中的转录本表达情况,但该数据集具体覆盖哪些基因、转录本或表达定量指标,源站未提供。数据集是否包含原始测序读段、比对结果或表达矩阵等具体文件类型,源站未提供。样本的临床信息、分型信息、治疗背景或随访信息,源站未提供。因此,从现有信息可以确认的是样本数量、数据层级数量以及参考基因组版本,而更细粒度的分子或临床属性需以源站文档和实际下载内容为准。

【采集与来源】

该数据集来源站为 omicsdi.org,源站描述说明其属于 BLUEPRINT release August 2016。数据针对 14 个多发性骨髓瘤样本,包含 14 个 run、14 个 experiment 和 14 个 analysis,并基于 human genome GRCh38。源站还提供了分析文档地址:http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/blueprint/releases/20160816/homo_sapiens/README_rnaseq_analysis_crg_20160816。该文档可用于了解 RNA-Seq 分析相关说明。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、测序平台和建库方法等,源站未提供。关于数据的具体提交机构、项目负责人或联系方式,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于多发性骨髓瘤转录组相关的探索性研究,例如作为 RNA-Seq 表达分析的公开数据资源,用于方法验证、流程测试或与其他骨髓瘤转录组数据进行比较分析。由于数据基于 GRCh38,使用者可在该参考基因组版本下开展比对、定量和注释相关工作的复现或扩展。该数据集也可用于 BLUEPRINT 项目相关研究的背景调研,帮助了解 2016 年 8 月发布中多发性骨髓瘤样本的 RNA-Seq 数据组成。但具体适用场景受限于样本数量为 14 例,且缺乏临床与表型信息,因此不适合直接推断疾病机制、临床结局或群体特征。是否适合作为训练集、验证集或对照集,需结合源站分析文档和实际数据内容判断。

【使用方法】

使用者可通过来源站 omicsdi.org 获取该数据集的入口信息,并依据源站描述定位到 BLUEPRINT 2016 年 8 月发布的相关资源。源站提供的分析文档链接可用于了解 RNA-Seq 分析流程与文档说明。由于数据集基于 human genome GRCh38,使用时应确保参考基因组版本一致,以避免坐标或注释差异。数据包含 14 个 run、14 个 experiment 和 14 个 analysis,使用时可按照这些层级组织下载与整理。关于具体的下载方式、文件格式、数据处理步骤、软件参数和质控标准,源站未提供。关于是否允许二次分析、是否需要注册或遵守特定访问条件,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集明确包含 14 个多发性骨髓瘤样本,并对应 14 个 run、14 个 experiment 和 14 个 analysis,基于 human genome GRCh38,属于 BLUEPRINT release August 2016。其限制在于样本数量较少,且源站未提供临床信息、表型信息、测序质量指标、覆盖度、批次信息或重复样本信息。由于缺乏这些细节,无法从现有信息判断数据质量高低、是否存在批次效应或是否适合进行统计推断。此外,源站未提供数据版本更新情况、错误修正记录或质控报告。使用者应结合源站分析文档和实际数据检查结果,评估数据是否满足具体研究需求。

【引用与许可】

该数据集来源站为 omicsdi.org,源站描述指出其属于 BLUEPRINT release August 2016,并提供了分析文档地址。关于该数据集的正式引用格式、文献出处、作者列表、贡献者信息以及许可协议,源站未提供。关于是否允许商业使用、再分发或修改,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时,应优先查阅 omicsdi.org 页面及 BLUEPRINT 相关发布文档,以获取准确的引用与许可要求。

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数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001002401

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

RNA-Seq data for 14 Multiple Myeloma sample(s). 14 run(s), 14 experiment(s), 14 analysis(s) on human genome GRCh38. Part of BLUEPRINT release August 2016. Analysis documentation available at http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/blueprint/releases/20160816/homo_sapiens/README_rnaseq_analysis_crg_20160816

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