BP 2015年8月 RNA-Seq 多发性骨髓瘤 GRCh38 样本集

该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤领域的多发性骨髓瘤数据,包含 11 个多发性骨髓瘤样本的 RNA-Seq 数据,共 11 次运行、11 个实验和 11 个比对结果,均基于人类基因组 GRCh38

omicsdi
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基因组分类Genomics
BP_August_2015_RNA-Seq_Multiple_myeloma_on_GRCh38 - samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

BP 2015年8月 RNA-Seq 多发性骨髓瘤 GRCh38 样本集

BP_August_2015_RNA-Seq_Multiple_myeloma_on_GRCh38 - samples 是一个面向多发性骨髓瘤研究的 RNA 测序样本数据集,归属于肿瘤领域。该数据集来源于 omicsdi.org,主题标签为 Genomics。其核心内容是对 11 个多发性骨髓瘤样本进行 RNA-Seq 检测,共包含 11 次运行、11 个实验和 11 个比对结果,所有数据均基于人类基因组 GRCh38 进行比对。作为 BLUEPRINT 项目 2015 年 8 月发布内容的一部分,该数据集为研究多发性骨髓瘤的转录组特征提供了样本层面的基础资源,适用于需要以 GRCh38 为参考进行基因表达分析或转录组探索的研究场景。

【数据集背景】

多发性骨髓瘤是一种血液系统恶性肿瘤,对其转录组进行研究有助于理解疾病相关的基因表达变化。该数据集属于 BLUEPRINT 项目 2015 年 8 月发布内容的一部分。BLUEPRINT 项目关注血液细胞的表观基因组和转录组特征,该数据集作为其中多发性骨髓瘤相关 RNA-Seq 数据的一个组成部分,提供了针对该疾病样本的测序资源。数据集在 omicsdi.org 上被归类于肿瘤领域下的多发性骨髓瘤方向,主题标签为 Genomics。

【数据内容】

该数据集包含 11 个多发性骨髓瘤样本的 RNA-Seq 数据。具体而言,数据由 11 次运行、11 个实验和 11 个比对结果组成。所有比对均基于人类基因组 GRCh38 完成。数据集英文名称为 BP_August_2015_RNA-Seq_Multiple_myeloma_on_GRCh38 - samples,表明其样本层面的组织方式。数据内容围绕 RNA-Seq 展开,可用于获取这些多发性骨髓瘤样本的转录组信息。除上述样本数、运行数、实验数和比对结果数之外,源站未提供更详细的基因表达矩阵、变异信息或样本临床属性等内容。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org,属于 BLUEPRINT 项目 2015 年 8 月发布的一部分。源站描述指出,该数据为 11 个多发性骨髓瘤样本的 RNA-Seq 数据,包含 11 次运行、11 个实验和 11 个比对结果,均基于人类基因组 GRCh38。分析文档可通过源站提供的链接获取,链接指向 BLUEPRINT 发布目录下的 RNA-Seq 分析说明文件。除来源站和 BLUEPRINT 发布信息外,源站未提供样本采集地点、采集时间、伦理审批或具体实验操作流程等更多采集细节。

【适用场景】

该数据集适用于多发性骨髓瘤相关的转录组研究场景。由于提供了基于 GRCh38 的 RNA-Seq 比对结果,可用于基因表达分析、转录本结构探索以及不同样本间的表达比较等通用分析目的。其作为 BLUEPRINT 项目发布内容的一部分,也可用于与该项目中其他血液相关数据集进行联合分析或比较研究。主题标签 Genomics 表明其适用于基因组学范畴下的研究。除上述通用用途外,源站未提供该数据集特定的适用场景或已验证的分析结论。

【使用方法】

该数据集可通过 omicsdi.org 获取,并关联至 BLUEPRINT 项目的发布页面。源站描述中提供了分析文档的链接,指向 BLUEPRINT 2015 年 8 月发布目录下的 RNA-Seq 分析说明文件,用户可参考该文档了解分析流程。数据以样本为单位组织,包含运行、实验和比对结果,用户可根据自身分析需求下载并使用这些 RNA-Seq 数据。关于具体的下载方式、文件格式、数据处理步骤或软件参数等,源站未提供进一步说明。

【质量与限制】

该数据集包含 11 个多发性骨髓瘤样本,样本数量有限,可能影响统计功效或群体代表性。所有数据基于人类基因组 GRCh38 进行比对,参考基因组版本明确。作为 BLUEPRINT 项目 2015 年 8 月发布的一部分,其分析文档可追溯。然而,源站未提供关于数据质量评估指标、测序深度、覆盖度、批次效应或样本临床信息等详细内容,因此无法对数据质量进行更具体的判断。此外,源站未提供该数据集是否存在已知技术偏差或使用限制的说明。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式或许可信息。用户在使用时需自行参考 omicsdi.org 及 BLUEPRINT 项目发布页面的相关说明。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001001471

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

RNA-Seq data for 11 Multiple myeloma sample(s). 11 run(s), 11 experiment(s), 11 alignment(s) on human genome GRCh38. Part of BLUEPRINT release August 2015. Analysis documentation available at http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/blueprint/releases/20150820/homo_sapiens/README_rnaseq_analysis_crg_20150820

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