GEO 间皮瘤诊断与预后微阵列数据集 (GSE2514)

该基因芯片数据集包含恶性胸膜间皮瘤和肺腺癌样本的基因表达测定,常用于两者的鉴别诊断分子标志物研究以及生存预后分析。由National Center for Biotechnology Information提供,来自Gene Expression Omnibus,数据格式为表格,包含56条数据记录,适用于分类任务,许可证为Open Data Commons。

National Center for Biotechnology InformationNational Center for Biotechnology Information
Gene Expression Omnibus
2021-11-20 更新
浏览 25
表格分类Expression profiling by arrayGPL819606
GEO Mesothelioma Diagnosis and Prognosis Microarray Dataset (GSE2514)

基本信息

模态
表格
大小
0.05 GB
数据量
56
任务类型
分类
许可
Open Data Commons
创建/更新时间
2021-11-20

资源简介

GEO 间皮瘤诊断与预后微阵列数据集 (GSE2514)

【一句话概览】

该数据集主题为肺部肿瘤,原始描述仅标注“Lung tumors”,未提供更多细节。数据集包含1个文件,采用微阵列表达谱分析技术,涉及平台GPL81,物种为人类(9606)(来源 NCBI)。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Lung tumors》。源站首次发布:Apr 11 200。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL81、9606。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE2514

【使用注意】

· 源站最后修改于 Dec 13 201,引用时请注意版本时效。

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源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE2514

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 0.05 GB。

数据说明

该基因芯片数据集包含恶性胸膜间皮瘤和肺腺癌样本的基因表达测定,常用于两者的鉴别诊断分子标志物研究以及生存预后分析。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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