探索髓母细胞瘤亚组边界的合成数据生成

该数据集包含通过变分自编码器生成的髓母细胞瘤合成基因表达数据,数据模态为基因表达谱和临床亚组标签,主要包含真实与合成患者的基因表达矩阵及对应的肿瘤亚组分类信息,用于扩充样本以研究髓母细胞瘤亚组之间的边界特征,支持肿瘤亚型分类、合成数据验证及生物信息学方法开发等研究方向。

Barcelona Supercomputing CenterBarcelona Supercomputing Center
Zenodo
2025-12-19 更新
浏览 29
分类肿瘤亚型分类合成数据生成
Exploring the Boundaries of Medulloblastoma Subgroups with Synthetic Data Generation Dataset

基本信息

大小
0.285550039 GB
任务类型
分类
许可
apache2.0
创建/更新时间
2025-12-19

资源简介

探索髓母细胞瘤亚组边界的合成数据生成

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Exploring the Boundaries of Medulloblastoma Subgroups with Synthetic Data Generation》。项目资助方:Robust Learning and Reasoning for Complex Event Forecasting。源站首次发布:2024-12-31。

【数据内容】

源站原始描述:These datasets contain the synthetic data generated with a VAE in the Exploring the Boundaries of Medulloblastoma Subgroups with Synthetic Data Generation publication ( ). First, `augmented_data.csv` contains both the real and synthetic patients as rows, and the corresponding genes as columns. Second, `augmented_metadata.csv` contains the subgroup to which each patient, synthetic and real, belong to: WNT, SHH, Group 3, Group 4, G3-G4, synthetic_Group 3, synthetic_Group 4, synthetic_G3-G4

主表 augmented_metadata.csv 含 2 列、样本前 1364 行结构完整。

【数据结构与技术规格】

文件数 2 个,合计 285.55 MB。数据集 DOI:10.5281/zenodo.14516824。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/records/14516824

使用许可:apache2.0。

【使用注意】

· 源站最后修改于 2025-12-19,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Zenodo 公开直链)

源站:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.14516823

(注册/登录后按页面指引下载)

数据说明

该数据集是《探索髓母细胞瘤亚组边界的合成数据生成》研究论文中生成的合成数据。数据集包含两个主要文件:augmented_data.csv 包含真实患者和合成患者的基因表达数据,以患者为行、基因为列;augmented_metadata.csv 则标注了每位患者(包括真实和合成)所属的髓母细胞瘤亚组,包括 WNT、SHH、Group 3、Group 4、G3-G4 以及对应的合成亚组。数据通过变分自编码器(VAE)生成,旨在扩充真实数据样本,用于研究髓母细胞瘤亚组分类的边界和特征。主要应用于肿瘤亚型分类、合成数据生成、生物信息学分析等研究方向。

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