套细胞淋巴瘤整合基因组分析数据集

包含64例未治疗原发套细胞淋巴瘤的表达芯片数据,用于拷贝数改变、通路异常和预后相关分子研究。由National Cancer Institute提供,来自Gene Expression Omnibus,数据格式为表格,适用于分类任务。

National Cancer InstituteNational Cancer Institute
Gene Expression Omnibus
2019-03-25 更新
浏览 22
表格分类Expression profiling by arrayGPL5709606
GSE21452

基本信息

模态
表格
大小
0.31 GB
数据量
64
任务类型
分类
创建/更新时间
2019-03-25

资源简介

套细胞淋巴瘤整合基因组分析数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Integrated genomic profiling in mantle cell lymphoma》。源站首次发布:Apr 22 201。

【数据内容】

源站原始描述:The genome of mantle cell lymphoma (MCL) is, in addition to the translocation t(11;14), characterized by a high number of secondary chromosomal gains and losses that likely account for the varying survival times of MCL patients. We investigated 77 primary MCL tumors with available clinical information using high resolution RNA expression and genomic profiling and applied our recently developed gene expression and dosage integrator (GEDI) algorithm to identify novel genes and pathways that may be…

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL570、9606。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE21452

【使用注意】

· 源站最后修改于 Mar 25 201,引用时请注意版本时效。

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源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE21452

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 0.31 GB。

数据说明

包含64例未治疗原发套细胞淋巴瘤的表达芯片数据,用于拷贝数改变、通路异常和预后相关分子研究。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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