MPNST拷贝数变异数据集
该 GEO 数据集包含 51 例原发 MPNST 组织的 array-CGH 数据,用于分析复发性拷贝数异常和潜在治疗靶点。由Tampere University of Technology提供,来自Gene Expression Omnibus,数据格式为表格,适用于分类任务,专注于肿瘤领域的恶性周围神经鞘膜瘤(MPNST)研究。

基本信息
资源简介
MPNST拷贝数变异数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Genomic characterization of the MPNST》。源站首次发布:Nov 22 201。
【数据内容】
源站原始描述:Malignant peripheral nerve sheath tumor (MPNST) is a rare sarcoma that lacks effective therapeutic strategies. By characterizing recurrent gene copy number aberrations, we gain insight into the most altered pathways with the purpose of scanning possible therapeutic targets
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签:Genome variation profiling by array、GPL5477、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE33881
【使用注意】
· 源站最后修改于 Dec 06 201,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
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源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE33881
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该 GEO 数据集包含 51 例原发 MPNST 组织的 array-CGH 数据,用于分析复发性拷贝数异常和潜在治疗靶点。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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