林奇样综合征患者综合遗传与表观遗传特征相关数据集

该数据集包含123个样本(涵盖林奇综合征、林奇样综合征、散发性病例及健康对照)的全基因组DNA甲基化数据,通过Illumina Infinium MethylationEPIC芯片获取,数据模态为表观遗传学数值矩阵,主要用于研究林奇样综合征的表观遗传特征、探索DNA甲基化模式与疾病关联,并支持肿瘤遗传学和生物标志物开发等研究方向。

Zenodo
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2024-11-14 更新
林奇样综合征表观遗传学全基因组DNA甲基化分析
创建时间2024-11-14
更新时间2024-11-14
原始链接

https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.11543343

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资源简介

该数据集源自论文《林奇样综合征患者综合遗传与表观遗传特征研究》,包含通过Illumina Infinium Human Methylation EPIC BeadChip芯片分析获得的β值矩阵。数据覆盖林奇综合征患者、林奇样综合征患者、散发性病例及健康对照共123个样本的DNA甲基化信息,涉及740,840个探针。数据来源于外周血淋巴细胞提取的DNA,经过亚硫酸盐转化、芯片杂交、荧光扫描等标准流程,并使用ChAMP软件包进行质量控制、预处理及归一化。该数据集主要用于林奇样综合征的表观遗传机制研究,特别是全基因组DNA甲基化模式分析,可支持肿瘤遗传学、生物标志物发现等研究方向。

提供机构:Zenodo

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影像Dataset for Comprehensive genetic and epigenetic characterization of Lynch-Like Syndrome patients