组蛋白去乙酰化酶抑制剂Vorinostat通过翻译抑制抑制缺氧诱导因子1α表达

该数据集来自 plos.figshare.com,配套论文发表于 PLoS ONE(2014 年),包含 5 个 TIF 格式的补充图文件

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2023-05-31 更新
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蛋白质eukaryotic translation initiation factorcutaneous T cell lymphomaPrevious studiessahaHDAC activitySuberoylanilide Hydroxamicblock tumor angiogenesisacetylation statusfdaeIF 3HDrug administrationHepatocellular carcinoma
The Histone Deacetylase Inhibitor, Vorinostat, Represses Hypoxia Inducible Factor 1 Alpha Expression through Translational Inhibition

基本信息

模态
蛋白质
大小
0.005721894 GB
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-05-31
版本
v1

资源简介

组蛋白去乙酰化酶抑制剂Vorinostat通过翻译抑制抑制缺氧诱导因子1α表达

The Histone Deacetylase Inhibitor, Vorinostat, Represses Hypoxia Inducible Factor 1 Alpha Expression through Translational Inhibition

该数据集来自 plos.figshare.com,配套论文发表于 PLoS ONE(2014 年),包含 5 个 TIF 格式的补充图文件。数据围绕 FDA 批准的组蛋白去乙酰化酶抑制剂 Vorinostat/SAHA 与 Romidepsin 展开,涉及皮肤 T 细胞淋巴瘤治疗背景,以及 HIF-1α 表达调控、Hsp70/Hsp90 伴侣轴、乙酰化状态和真核翻译起始因子等主题。可用于肿瘤血管生成与淋巴瘤相关机制研究的参考(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《The Histone Deacetylase Inhibitor, Vorinostat, Represses Hypoxia Inducible Factor 1 Alpha Expression through Translational Inhibition》发表于 PLoS ONE(2014),DOI:10.1371/journal.pone.0106224。源站首次发布:2014-08-28。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):缺氧诱导因子1α(HIF-1α)是肿瘤血管生成的主要调控因子,是癌症治疗的主要靶点之一。既往研究表明,组蛋白去乙酰化酶抑制剂(HDACi)通过抑制HIF-1α表达来阻断肿瘤血管生成。因此,Vorinostat(Suberoylanilide Hydroxamic Acid/SAHA)和Romidepsin这两种HDACi最近被美国食品药品监督管理局(FDA)批准用于治疗皮肤T细胞淋巴瘤。尽管已显示HDACi可通过调节HIF-1α与Hsp70/Hsp90伴侣轴的相互作用或其乙酰化状态来影响HIF-1α表达,但HDACi抑制HIF-1α表达的分子机制仍需进一步表征。在此,我们报告FDA批准的HDACi Vorinostat/SAHA通过一种不依赖p53、脯氨酰羟化的新机制抑制肝癌来源细胞系中的HIF-1α表达。

【数据结构与技术规格】

文件数 5 个,合计 5.72 MB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0106224。

【主题与分类】

源站学科分类:Biological Sciences。主题标签:eukaryotic translation initiation factor、cutaneous T cell lymphoma、Previous studies、saha、HDAC activity、Suberoylanilide Hydroxamic、block tumor angiogenesis、acetylation status、fda、eIF 3H。本站分类:肿瘤/淋巴瘤。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biological Sciences。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/_The_Histone_Deacetylase_Inhibitor_Vorinostat_Represses_Hypoxia_Inducible_Factor_1_Alpha_Expression_through_Translational_Inhibition_/1154542

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Hutt, Darren M.; Martino Roth, Daniela; Vignaud, Hélène; Cullin, Christophe; Bouchecareilh, Marion (2016). The Histone Deacetylase Inhibitor, Vorinostat, Represses Hypoxia Inducible Factor 1 Alpha Expression through Translational Inhibition. PLOS ONE. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-05-31,引用时请注意版本时效。

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curl -L -o "Figure_S5.tif" "https://ndownloader.figshare.com/files/1653726"

文件清单

  • Figure_S1.tif(527.03 KB)
  • Figure_S2.tif(949.09 KB)
  • Figure_S3.tif(915.49 KB)
  • Figure_S4.tif(2.18 MB)
  • Figure_S5.tif(1.15 MB)

文件总体积 5.72 MB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

缺氧诱导因子1α(HIF-1α)是肿瘤血管生成的主要调控因子,也是癌症治疗的主要靶点之一。既往研究表明,组蛋白去乙酰化酶抑制剂(HDACi)通过抑制HIF-1α表达来阻断肿瘤血管生成。因此,Vorinostat(辛二酰苯胺异羟肟酸/SAHA)和Romidepsin这两种HDACi近期获美国食品药品监督管理局(FDA)批准用于治疗皮肤T细胞淋巴瘤。尽管已有研究显示HDACi可通过调节HIF-1α与Hsp70/Hsp90伴侣轴的相互作用或其乙酰化状态来影响HIF-1α表达,但HDACi抑制HIF-1α表达的分子机制仍需进一步阐明。在此,我们报道FDA批准的HDACi Vorinostat/SAHA通过一种不依赖于p53、脯氨酰羟化酶、自噬和蛋白酶体降解的新机制,抑制肝癌来源细胞系中HIF-1α的表达。我们发现,SAHA或沉默HDAC9的作用机制在于抑制HIF-1α翻译,而这又是由真核翻译起始因子eIF3G所介导的。

我们还强调,当SAHA与eIF3H沉默联合使用时,HIF-1α的翻译受到显著抑制。综上所述,我们的研究表明HDAC活性调控HIF-1α的翻译,而诸如SAHA之类的HDAC抑制剂代表了治疗肝细胞癌的一种潜在新方法。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0106224(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/_The_Histone_Deacetylase_Inhibitor_Vorinostat_Represses_Hypoxia_Inducible_Factor_1_Alpha_Expression_through_Translational_Inhibition_/1154542)。

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