套细胞淋巴瘤单细胞RNA转录组学揭示诊断时存在治疗耐药亚克隆的补充数据表
该数据集为套细胞淋巴瘤单细胞RNA转录组研究的补充数据表，包含5个Excel文件，涵盖光学基因组图谱、差异表达基因、Reactome通路基因集分析、全外显子测序拷贝数变异片段及短核苷酸变异检测结果
基本信息
资源简介
套细胞淋巴瘤单细胞RNA转录组学揭示诊断时存在治疗耐药亚克隆的补充数据表
Single Cell RNA Transcriptomics of Mantle Cell Lymphoma Reveals the Presence of Treatment-Resistant Subclones at the Time of Diagnosis - Supplementary Data Tables
该数据集为套细胞淋巴瘤单细胞RNA转录组研究的补充数据表，包含5个Excel文件，涵盖光学基因组图谱、差异表达基因、Reactome通路基因集分析、全外显子测序拷贝数变异片段及短核苷酸变异检测结果。数据涉及患者P009和P069在诊断与复发时间点的基因组与转录组特征，可用于识别治疗耐药亚克隆、分析克隆演化及比较不同时间点的分子改变（来源 Zenodo，cc-by-sa-4.0 许可）。
【数据集背景】
源站首次发布：2024-08-05。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：补充表4。患者P009的光学基因组图谱结果。该表列出了诊断和复发时共有的基因组畸变以及两个时间点各自独有的畸变。补充表5。每位患者中DGs亚克隆与DGex相比的差异表达基因列表。使用DECENT R包进行伪批量分析的结果。补充表6。使用Reactome通路对DGs亚克隆与DGex相比的差异表达基因进行基因集分析的结果。补充表7。使用全外显子测序数据预测的拷贝数变异片段。使用CNVkit进行拷贝片段分析和拷贝数调用的结果。补充表8。在诊断时PBMC和复发时骨髓及肠道样本的全外显子测序数据中检测到的患者P069的短核苷酸变异。使用Mutect2变异调用算法的结果。
【数据结构与技术规格】
文件数 5 个，合计 5.69 MB。数据集 DOI：10.5281/zenodo.13220569。
【主题与分类】
主题标签：套细胞淋巴瘤、单细胞RNA转录组、治疗耐药亚克隆、差异表达基因、拷贝数变异、基因集分析。本站分类：肿瘤/淋巴瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://zenodo.org/records/13220569
使用许可：cc-by-sa-4.0。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Zenodo 公开直链）
curl -L -o "Supplementary Table 4 - Optical genomic mapping.xlsx" "https://zenodo.org/api/records/13220569/files/Supplementary%20Table%204%20-%20Optical%20genomic%20mapping.xlsx/content"
curl -L -o "Supplementary Table 5 - DEGs.xlsx" "https://zenodo.org/api/records/13220569/files/Supplementary%20Table%205%20-%20DEGs.xlsx/content"
curl -L -o "Supplementary Table 7 - CNV calls.xlsx" "https://zenodo.org/api/records/13220569/files/Supplementary%20Table%207%20-%20CNV%20calls.xlsx/content"
curl -L -o "Supplementary Table 6 - GSA.xlsx" "https://zenodo.org/api/records/13220569/files/Supplementary%20Table%206%20-%20GSA.xlsx/content"
curl -L -o "Supplementary Table 8 - SNV calls.xlsx" "https://zenodo.org/api/records/13220569/files/Supplementary%20Table%208%20-%20SNV%20calls.xlsx/content"
文件清单
Supplementary Table 4 - Optical genomic mapping.xlsx（0.0 MB）Supplementary Table 5 - DEGs.xlsx（4.4 MB）Supplementary Table 7 - CNV calls.xlsx（1.0 MB）Supplementary Table 6 - GSA.xlsx（0.1 MB）Supplementary Table 8 - SNV calls.xlsx（0.0 MB）
数据集大小约 5.7 MB。
数据说明
补充表4. 患者P009的光学基因组图谱结果。该表列出了诊断和复发时共有的基因组畸变，以及两个时间点各自独有的畸变。补充表5. 每位患者中DGs亚克隆与DGex相比的差异表达基因列表。使用DECENT R包进行伪批量分析的结果。补充表6. 使用Reactome通路对DGs亚克隆与DGex相比的差异表达基因进行的基因集分析结果。补充表7. 使用全外显子组测序数据预测的拷贝数变异片段。使用CNVkit进行拷贝片段分析和拷贝数判定的结果。补充表8. 在P069的全外显子组测序数据中检测到的短核苷酸变异，包括诊断时PBMC样本以及复发时骨髓和肠道样本。Mutect2变异检测算法的结果。
许可
cc-by-sa-4.0
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