单细胞表型分析识别复发难治性弥漫大B细胞淋巴瘤免疫细胞蛋白生物标志物：单中心研究

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.5899714

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 684.3 MB。

数据说明

弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）是最常见的侵袭性非霍奇金淋巴瘤类型。细胞起源（COO）分类与患者的预后相关。在DLBCL治疗中已观察到原发性耐药现象。对于那些患有复发和难治性（R/R）-DLBCL的患者，其特定的血清生物标志物仍不明确。在当前研究中，我们采用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和质谱流式技术（CyTOF），从18例R/R DLBCL患者诊断时的外周血单个核细胞（PBMC）样本中，在单细胞分辨率水平上确定并验证了mRNA和蛋白质层面的免疫细胞生物标志物。作为对照，我们获取了5例健康志愿者的PBMC样本。通过对8例R/R DLBCL患者样本进行scRNA-seq，我们鉴定出一组35个表面标记基因，这些基因体现了R/R DLBCL独特细胞簇的特征，并在由10例R/R DLBCL患者组成的外部队列中通过CyTOF验证了其有效性。在CyTOF空间中，我们以COO及C-MYC表达指定为基准，比较了R/R DLBCL样本间的细胞聚类和降维情况。

来自每位患者的免疫细胞在32维表型空间中占据独特区域，样本未明显聚类为离散亚型。在亚组中观察到的显著异质性主要归因于样本间的个体差异，而非单一均质性免疫细胞亚群的表达差异。该标志物组合在标记R/R DLBCL方面显示出可靠性，且不受COO分型和C-MYC表达指定的影响。此外，我们比较了R/R DLBCL与正常样本之间的所有标志物。共有12种生物标志物在R/R DLBCL中相对于正常样本显著过表达。因此，我们进一步优化了R/R DLBCL的诊断生物标志物组合，包括CD82、CD55、CD36、CD63、CD59、IKZF1、CD69、CD163、CD14、CD226、CD84和CD31。总之，我们开发了一种新型

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。