弥漫大B细胞淋巴瘤抗原非依赖性自主B细胞受体信号传导数据集

该数据集包含15例弥漫大B细胞淋巴瘤患者样本的全外显子测序原始数据,以基因组模态的FASTQ格式存储,主要用于研究DLBCL中B细胞受体的抗原非依赖性自主信号传导机制,支持变异检测、拷贝数分析、结构变异识别及分子分型等下游分析,为理解DLBCL发病机制和开发靶向治疗提供关键基因组学资源。

DataONE
2025-08-14 更新
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癌症研究基因组学

基本信息

创建/更新时间
2025-08-14

资源简介

该数据集是针对弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)的研究数据,主要包含15例DLBCL患者样本的全外显子测序(WES)原始数据,以FASTQ格式存储。数据来源于莱顿大学医学中心的病理档案库,通过SureSelect Human All Exon V7试剂盒捕获,在Illumina HiSeq2000平台上测序获得,平均覆盖深度为50倍。该数据集旨在研究DLBCL中B细胞受体(BCR)的抗原非依赖性自主信号传导机制,特别关注活化B细胞亚型(ABC-DLBCL)的慢性活性BCR信号传导和NF-κB激活。数据可用于变异检测、拷贝数变异分析、结构变异识别以及使用LymphGen算法进行分子分型等下游分析,为DLBCL的发病机制研究和精准治疗提供重要资源。

原始链接

https://search.dataone.org/view/sha256:2c8a3a5c5a9e5289cd752bf2abe08d7195faa7cc4320c2183614276c551a1b76

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    • ModelScope: pip install modelscopemodelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集是针对弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)的研究数据,主要包含15例DLBCL患者样本的全外显子测序(WES)原始数据,以FASTQ格式存储。数据来源于莱顿大学医学中心的病理档案库,通过SureSelect Human All Exon V7试剂盒捕获,在Illumina HiSeq2000平台上测序获得,平均覆盖深度为50倍。该数据集旨在研究DLBCL中B细胞受体(BCR)的抗原非依赖性自主信号传导机制,特别关注活化B细胞亚型(ABC-DLBCL)的慢性活性BCR信号传导和NF-κB激活。数据可用于变异检测、拷贝数变异分析、结构变异识别以及使用LymphGen算法进行分子分型等下游分析,为DLBCL的发病机制研究和精准治疗提供重要资源。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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