PXD001124：脾边缘区淋巴瘤组织蛋白质组学

数据集获取

源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD001124

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

脾边缘区淋巴瘤（SMZL）是一种罕见的慢性B细胞淋巴增殖性疾病，其分子发病机制仍未充分明确。首次采用蛋白质组学方法分析SMZL组织的蛋白质图谱。同时进行Western blot、免疫组织化学分析和功能数据挖掘，以验证结果、对蛋白质进行分类并探索其潜在关系。我们证明，SMZL的特征是与能量代谢和凋亡通路相关的蛋白质发生调节。我们还报道了直接参与NF-κB和BCR通路以及染色质重塑和细胞骨架的特定蛋白质（如胆绿素还原酶A、锰超氧化物歧化酶、β2微球蛋白、生长因子受体结合蛋白2、酸性富含亮氨酸核磷蛋白32家族成员A和SET核癌基因）。我们的发现为SMZL发病机制提供了新的见解，并为未来新型生物标志物的开发奠定了基础。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。