不同种族人群中Epstein-Barr病毒的蛋白质研究

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT00070785

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件：EB病毒感染。EB病毒（EBV）可在免疫抑制患者中诱发致死性淋巴增殖性病变，这些病变在免疫抑制逆转或过继转移EBV特异性CD8+ T细胞后可消退。EBV还可在免疫健全宿主中诱发肿瘤性病变，包括伯基特淋巴瘤、霍奇金病和鼻咽癌（NPC）。这些癌症患者中可出现EBV特异性CD8+ T细胞应答，其性质与EBV致敏的正常个体相似，但数量上有所减少。尽管这些癌症具有若干共同特征，但其EBV蛋白表达模式存在差异。特别是，NPC优先表达潜伏膜蛋白（LMP）2，伴或不伴LMP 1表达，并中等程度表达EB病毒核抗原。因此，有必要开发针对NPC患者的LMP 2导向免疫接种，希望增强不足的自然免疫可导致肿瘤消退。

由于鼻咽癌（NPC）的发病率与种族背景（主要为华南人群）及人类白细胞抗原（HLA）表型密切相关，不同人群对EBV表位可能表现出不同的反应模式，而这可能正是各自易感鼻咽癌的原因所在。尽管已描述了若干LMP2表位，但据我们所知，尚未开展过结合高分辨率HLA分型的跨种族系统性表位图谱绘制。因此，我们拟通过检测暴露于覆盖LMP2全序列的重叠九聚肽文库的循环淋巴细胞中干扰素（IFN）-γ转录本水平，来绘制白种人或亚洲（中国）裔EBV致敏正常个体中LMP2的免疫优势表位图谱。基于序列的高分辨率HLA分型将作为本研究的补充。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。