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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1537115：针对Epstein-Barr病毒的体液免疫应答呈现毒株特异性与HIV驱动模式

PRJNA1537115 是一个以“针对 Epstein-Barr 病毒的体液免疫应答呈现毒株特异性并受 HIV 驱动”为主题的生物项目记录，收录于 NCBI 的 BioProject 数据库，在本地分类中归入肿瘤 / 淋巴瘤方向。该记录本身是一个项目级的入口，用于汇集围绕这一单一研究计划所产生的各类生物数据。根据 BioProject 的通用定义，此类记录由单一机构或联盟发起，旨在为用户提供查找该项目所生成多种数据类型链接的统一位置。因此，本数据集的价值首先体现在其作为研究计划索引与数据导航节点的作用，而非单一实验或单一测序文件的集合。其主题标签为“Other”，提示该项目在 NCBI 的主题归类中未落入更具体的预设类别。

【数据集背景】

该项目的英文名称为“PRJNA1537115: Humoral Response against Epstein-Barr Virus Follows a Strain-specific and HIV-Driven Pattern”，源站标题为“Humoral Response against Epstein-Barr Virus Follow... (ID 1537115) - BioProject - NCBI”。从名称可以看出，该项目关注的是针对 Epstein-Barr 病毒的体液免疫应答，并强调这种应答具有毒株特异性以及受 HIV 驱动的特征。项目在本地分类中属于肿瘤 / 淋巴瘤方向，说明其研究背景与肿瘤学、尤其是淋巴瘤领域存在关联。Epstein-Barr 病毒是一种与多种淋巴增殖性疾病相关的病毒，而 HIV 感染又是相关疾病的重要驱动因素之一，因此该项目所探讨的体液免疫应答模式，处于病毒学、免疫学与肿瘤学交叉的位置。源站未提供该项目的具体发起机构、联盟组成、资助来源及立项时间等信息。

【数据内容】

作为 BioProject 记录，该项目提供的是一个统一入口，用于链接该项目所生成的多样数据类型。源站描述指出，BioProject 是围绕单一研究计划、由单一机构或联盟发起的生物数据集合，为用户提供查找该项目所生成各类数据的统一入口。因此，本数据集的内容并非某一类具体的序列或表达数据，而是指向该项目下可能存在的多种数据资源。项目主题标签为“Other”，表明其在 NCBI 的主题分类中未被归入更具体的类别。源站未提供该项目具体包含的数据类型、样本数量、测序平台、数据文件格式及数据总量等信息。

【采集与来源】

该记录来源于 ncbi.nlm.nih.gov，即 NCBI 的 BioProject 数据库。BioProject 记录的通用定位是汇集与单一研究计划相关的生物数据，这些数据由单一机构或联盟发起并生成。就本项目而言，其数据来源应归属于发起该研究计划的机构或联盟，但源站未提供具体的机构名称、联盟成员、样本采集地点、采集时间及伦理审批等信息。源站也未提供该项目的样本来源人群、HIV 感染状态分组方式或 Epstein-Barr 病毒毒株鉴定方法等细节。

【适用场景】

该数据集适用于需要定位或检索“针对 Epstein-Barr 病毒的体液免疫应答”相关研究计划的场景，尤其是关注毒株特异性与 HIV 驱动模式的用户。由于其在本地分类中归入肿瘤 / 淋巴瘤，也可供淋巴瘤相关研究者在查找病毒免疫应答与肿瘤关联数据时作为入口使用。此外，作为 BioProject 记录，它适合用于跨数据类型的数据发现，帮助用户从一个统一位置出发，查找该项目所生成的不同类型数据。源站未提供该数据集在具体分析流程、临床决策或产品开发中的适用性说明。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 数据库访问该记录，以项目编号 PRJNA1537115 作为检索标识。BioProject 记录的通用使用方式是为用户提供查找该项目所生成各类数据的统一入口，因此使用者可借助该记录跳转至项目关联的多种数据资源。源站未提供该项目的具体访问权限、下载方式、API 接口、数据格式说明及配套分析工具等信息。

【质量与限制】

该记录为 BioProject 项目级条目，其质量与完整性取决于发起机构或联盟所提交的元数据及关联数据。源站描述仅说明了 BioProject 的通用性质，未对本项目的元数据完整性、数据准确性、样本代表性或实验重复性作出任何评价。项目主题标签为“Other”，意味着其在 NCBI 主题分类中未被归入更具体的类别，可能对按主题检索的用户造成一定限制。源站未提供该项目的质控指标、数据验证情况、版本更新记录及已知偏差等信息。

【引用与许可】

源站未提供该项目的引用格式、DOI、许可协议、使用条款及数据共享政策等信息。使用者如需引用或使用该项目数据，应直接查阅 NCBI BioProject 记录页面及相关关联数据页面以获取最新的引用与许可说明。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE349024

访问原始数据

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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1537115

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

EB病毒（EBV）是一种普遍存在的人类γ疱疹病毒，与多种恶性肿瘤存在因果关联，包括多种淋巴瘤和实体瘤。尽管其全球流行率很高，但针对EBV的体液免疫应答的全面图谱尚未被描述。此外，HIV-1合并感染如何影响这一应答，可为HIV-1感染者（PWH）癌症风险为何升高提供新的见解。在本研究中，我们采用噬菌体免疫沉淀测序（PhIP-Seq），使用VirScan噬菌体展示文库，以肽段分辨率绘制了来自撒哈拉以南非洲的115名成人（43例HIV阳性，72例HIV阴性）中针对EBV蛋白质组的抗体应答图谱，这些成人伴或不伴HIV-1合并感染。我们确定EBNA1、EBNA2、EBNA3B和病毒衣壳抗原蛋白BFRF3是免疫显性最强的EBV蛋白。观察到针对EBNA2的EBV 1型和2型之间存在差异性抗体反应性，其中1型在C端反式激活结构域（C-TAD）附近表现出增强的抗体识别。EBNA1中包含核定位序列（NLS）的特定区域是EBV蛋白质组中最常被靶向的表位。

我们全面且高分辨率的分析鉴定出若干免疫显性EBV蛋白，无论HIV-1感染状态如何，大多数个体都会针对这些蛋白产生应答。与未感染HIV的个体相比，HIV-1合并感染者（PWH）对大多数EBV蛋白的抗体识别增强，但这些应答的强度在整个蛋白质组中各不相同。总体而言，我们的研究结果提示，HIV-1合并感染改变了抗EBV应答的广度和强度，这可能反映出病毒再激活增加以及HIV驱动的免疫抑制机制，而这些机制可能影响EBV抗体应答的强度。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别