PRJEB15173：中心体扩增足以促进哺乳动物自发性肿瘤发生
该数据集来自NCBI，对应PRJEB15173项目，主题为中心体扩增与哺乳动物自发性肿瘤发生的关系。源站描述指出，研究通过小鼠模型证明额外中心体可增加肠道肿瘤起始，并足以驱动多组织自发性肿瘤，肿瘤伴有频繁有丝分裂错误和复杂核型
基本信息
资源简介
PRJEB15173：中心体扩增足以促进哺乳动物自发性肿瘤发生
PRJEB15173 数据集对应研究项目“Centrosome amplification is sufficient to promote spontaneous tumorigenesis in mammals”，来自 NCBI，在本站归类于肿瘤 / 淋巴瘤方向。该研究关注中心体扩增与哺乳动物自发性肿瘤发生之间的关系：中心体扩增是人类肿瘤的常见特征，但其究竟是肿瘤的原因还是结果此前并不清楚。研究建立了可在没有其他遗传缺陷的情况下持续增加中心体数量的小鼠模型，发现额外中心体可增加肠道肿瘤模型的肿瘤起始，并且足以驱动多种组织发生自发性肿瘤；这些肿瘤表现出频繁的有丝分裂错误和复杂核型，再现了人类癌症的常见特征。数据集中的序列来自对自发性肿瘤的全基因组随机 DNA 测序。
【数据集背景】
中心体扩增是人类肿瘤中普遍存在的现象，但它在肿瘤发生中扮演因果角色还是伴随结果，长期缺乏明确答案。该研究通过构建小鼠模型，在不引入其他遗传缺陷的前提下持续增加中心体数量，从而将中心体扩增这一变量单独分离出来，检验其与肿瘤起始和进展的关系。研究显示，额外中心体能够提高肠道肿瘤模型中的肿瘤起始水平，更重要的是，超数中心体足以驱动多个组织出现自发性肿瘤。相关肿瘤伴随频繁的有丝分裂错误和复杂核型，与人类癌症中的常见特征相呼应。这些结果支持中心体扩增、基因组不稳定与肿瘤发展之间存在直接的因果关系。
【数据内容】
该数据集的内容为全基因组随机 DNA 测序产生的序列，测序对象为自发性肿瘤。源站描述在此处未完整给出后续细节，因此关于样本数量、测序平台、读长、覆盖度、数据量、文件格式等具体参数，源站未提供。数据集的主题标签为“Other”，本站分类为肿瘤 / 淋巴瘤。
【采集与来源】
数据来源于 NCBI，对应项目编号 PRJEB15173。研究采用小鼠模型开展，模型的关键特征是在没有额外遗传缺陷的情况下中心体数量可以持续增加；数据集中的序列即来自对这些自发性肿瘤进行的随机全基因组 DNA 测序。除上述信息外，采样组织种类、样本处理流程、测序中心与时间等细节，源站未提供。
【适用场景】
基于现有描述，该数据集可用于围绕中心体扩增与肿瘤发生关系的基因组层面研究，例如分析自发性肿瘤的全基因组序列特征、考察与有丝分裂错误和复杂核型相关的基因组改变，以及作为中心体扩增驱动肿瘤发生这一实验体系的序列数据参考。由于源站未提供样本与测序参数的完整说明，具体分析设计需结合原始项目记录确认。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用说明、数据处理流程或分析建议。使用者应依据 NCBI 项目页面的原始记录获取数据访问方式与相关说明。
【质量与限制】
源站描述强调该研究在小鼠模型中证明了中心体扩增与肿瘤发展之间的因果关系，肿瘤具有频繁有丝分裂错误和复杂核型。但关于数据质量指标、测序深度、样本重复数、批次信息及潜在偏差等，源站未提供，无法据此评估数据质量。此外，该数据来自小鼠模型，向其他物种或人类临床情境的外推需谨慎。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用格式与许可条款信息。使用时应查阅 NCBI 项目 PRJEB15173 的原始页面以获取准确的引用要求和数据使用规定。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB15173
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
中心体扩增是人类肿瘤的一个常见特征，但这是导致人类癌症的原因还是其结果，目前尚不清楚。在此，我们报告了一种小鼠模型的建立，该模型能够在不伴随其他遗传缺陷的情况下持续增加中心体数量。我们发现，在肠道肿瘤小鼠模型中，额外的中心体会增加肿瘤的发生。最重要的是，我们证明超数中心体足以驱动多种组织中自发性肿瘤的发展。中心体扩增的肿瘤表现出频繁的有丝分裂错误，并具有复杂的核型，重现了人类癌症的一个常见特征。总之，我们的数据支持中心体扩增、基因组不稳定性和肿瘤发展之间存在直接的因果关系。本数据集中的序列来源于对经多西环素处理的Plk4小鼠中自发性T细胞淋巴瘤、B细胞淋巴瘤、鳞状细胞癌和一种肉瘤进行的随机全基因组DNA测序。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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