PRJDB12182：B细胞淋巴瘤中PD-L2的促肿瘤功能与调控图谱
与PD-L1不同，人们对另一种PD-1配体PD-L2在癌症中的生物学意义和调控机制知之甚少。我们构建了来自表达mock、Pd-l1和Pd-l2的小鼠肿瘤中非恶性细胞的单细胞转录组、表面表型以及T/B细胞受体库图谱
基本信息
资源简介
PRJDB12182：B细胞淋巴瘤中PD-L2的促肿瘤功能与调控图谱
PRJDB12182 数据集围绕 B 细胞淋巴瘤中 PD-L2 的促肿瘤功能与调控图景展开。与 PD-L1 相比，另一种 PD-1 配体 PD-L2 在癌症中的生物学意义和调控机制此前所知甚少。该研究构建了来自表达 mock、Pd-l1 和 Pd-l2 的小鼠肿瘤中非恶性细胞的单细胞转录组、表面表型以及 T/B 细胞受体库图谱，并鉴定了一个新的 PD-L2 外显子，同时通过 CAGE-seq 精确刻画了其转录起始位点。数据集归属于肿瘤 / 淋巴瘤分类，来源站为 ebi.ac.uk，可为研究 PD-L2 在淋巴瘤微环境中的表达调控与免疫相关功能提供单细胞层面的参考资源。
【数据集背景】
PD-1 配体家族中，PD-L1 已被广泛研究，而 PD-L2 在肿瘤中的生物学相关性及调控机制仍不清楚。该数据集对应的研究正是针对这一空白，以 B 细胞淋巴瘤为背景，考察 PD-L2 的促肿瘤功能及其调控格局。研究通过比较 mock、Pd-l1 与 Pd-l2 三种表达状态的小鼠肿瘤模型，试图揭示 PD-L2 与 PD-L1 在肿瘤非恶性细胞组成、表面表型及免疫受体库层面的差异，并进一步从转录起始位点层面解析 PD-L2 的调控基础。
【数据内容】
数据集包含小鼠肿瘤中非恶性细胞的单细胞转录组图谱、表面表型图谱以及 T 细胞和 B 细胞受体库图谱，覆盖 mock、Pd-l1、Pd-l2 三种表达条件的肿瘤模型。此外，研究还鉴定了一个新的 PD-L2 外显子，并利用 CAGE-seq 对转录起始位点进行了精确表征。上述内容共同构成了从单细胞表达谱、细胞表面特征、适应性免疫受体库到 PD-L2 转录调控元件的多层次数据集合。
【采集与来源】
数据来源于 ebi.ac.uk。研究对象为表达 mock、Pd-l1 和 Pd-l2 的小鼠肿瘤中的非恶性细胞。源站描述提及构建了单细胞转录组、表面表型以及 T/B 细胞受体库图谱，并开展了 CAGE-seq 实验以刻画 PD-L2 的转录起始位点。样本的具体数量、测序平台、建库策略及动物模型细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肿瘤免疫学与淋巴瘤微环境研究，尤其是围绕 PD-1/PD-L1 之外的第二配体 PD-L2 的生物学功能与调控机制探索。可用于比较 PD-L2 与 PD-L1 表达状态下肿瘤非恶性细胞的单细胞转录组差异、表面表型特征以及 T/B 细胞受体库组成变化；也可用于新鉴定 PD-L2 外显子及转录起始位点的相关分析。对于关注 PD-L2 转录调控、B 细胞淋巴瘤免疫微环境以及免疫检查点配体家族比较研究的用户具有参考价值。
【使用方法】
源站未提供具体的数据访问路径、文件格式、处理流程与分析工具说明。用户需依据 ebi.ac.uk 上该数据集对应记录的指引获取与使用数据。涉及单细胞转录组、表面表型、T/B 细胞受体库及 CAGE-seq 数据的整合分析方案，源站未提供。
【质量与限制】
源站未提供数据质量评估、批次信息、重复数或质控指标。该数据集基于小鼠肿瘤模型，研究结论向人类 B 细胞淋巴瘤的外推需谨慎。数据覆盖范围限于非恶性细胞及 mock、Pd-l1、Pd-l2 三种表达条件，其他肿瘤模型或细胞类型是否适用，源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可条款信息。使用时应遵循 ebi.ac.uk 对应记录中给出的相关要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJDB12182
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
与PD-L1不同，关于另一种PD-1配体PD-L2在癌症中的生物学意义和调控机制知之甚少。我们构建了来自模拟、Pd-l1和Pd-l2表达的小鼠肿瘤中非恶性细胞的单细胞转录组、表面表型以及T/B细胞受体库图谱。此外，我们发现了一个新的PD-L2外显子，并进行了CAGE-seq以精确表征转录起始位点。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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